RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557014.1

GTF3AP2-201, Transcript of general transcription factor IIIA pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene GTF3AP2, Length 266 nt, Biotype transcribed processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AP2-201ENST00000557014 ASB4Q9Y574 426 aa2.51□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 SNX8Q9Y5X2 465 aa2.51□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 CMYA5Q8N3K9 4069 aa2.51□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 A0A0A6YYD5 115 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 POM121CA8CG34 1229 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 ESPNB1AK53 854 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZNF814B7Z6K7 855 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 NPIPA7E9PJI5 369 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 TRIM77I1YAP6 450 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 LINC01387J3KSC0 135 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 NDUFS8O00217 210 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 TNFSF11O14788 317 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 ACOX3O15254 700 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 TAPBPO15533 448 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 CXCL13O43927 109 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 TSPAN2O60636 221 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 STK16O75716 305 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 LYZL6O75951 148 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 SYNGR4O95473 234 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 CLDN9O95484 217 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 TPM3P06753 285 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 TUBBP07437 444 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 NPIPA8P0DM63 369 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 CPMP14384 443 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 PORP16435 677 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 EPORP19235 508 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 NT5EP21589 574 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 DRD5P21918 477 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 APEX1P27695 318 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 IL12BP29460 328 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 EVI2BP34910 448 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 RBMXP38159 391 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 CASP2P42575 452 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 PPICP45877 212 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 KCNJ1P48048 391 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 HSPA7P48741 367 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 EMDP50402 254 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZNF83P51522 516 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 CORO7P57737 925 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 HILS1P60008 231 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 SARNPP82979 210 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 CDKL1Q00532 357 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 IRF8Q02556 426 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 CHRNEQ04844 493 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 MGAT2Q10469 447 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 CHIT1Q13231 466 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 LAPTM5Q13571 262 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 CCNIQ14094 377 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZNF460Q14592 562 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 SLMAPQ14BN4 828 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 TSNQ15631 228 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 PDK4Q16654 411 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 PAGE2BQ5JRK9 111 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 LGSNQ5TDP6 509 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 C6orf163Q5TEZ5 329 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 ARMC3Q5W041 872 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 OR52E8Q6IFG1 317 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 FAM111BQ6SJ93 734 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 SLC22A25Q6T423 547 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 CYP20A1Q6UW02 462 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 SHISA2Q6UWI4 295 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 TMEM108Q6UXF1 575 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 C4orf22Q6V702 233 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 B3GLCTQ6Y288 498 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 Q6ZSR9 355 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 FRA10AC1Q70Z53 315 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 GALNT10Q86SR1 603 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 CNGA4Q8IV77 575 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 TUSC5Q8IXB3 177 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 LMNTD2Q8IXW0 634 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 SVOPLQ8N434 492 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 LRRC17Q8N6Y2 441 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 ANKS4BQ8N8V4 417 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 FADS6Q8N9I5 356 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 LINC01356Q8N9X3 169 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 MCUQ8NE86 351 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 OR7G3Q8NG95 312 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 OR4N2Q8NGD1 307 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 OR4K14Q8NGD5 310 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 OR52R1Q8NGF1 315 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 OR10D3Q8NH80 312 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 DUSP19Q8WTR2 217 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 RNF138Q8WVD3 245 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3AP2-201ENST00000557014 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms