RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931		A8MT66	165 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	INAFM1	C9JVW0	142 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	MANBA	O00462	879 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	SEC14L5	O43304	696 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	EMC8	O43402	210 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	PCDH7	O60245	1069 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	PEPD	P12955	493 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	EVI2B	P34910	448 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	KRT20	P35900	424 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	CLDN20	P56880	219 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	RAET1L	Q5VY80	246 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	MEIOB	Q8N635	442 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	ERP27	Q96DN0	273 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	MTBP	Q96DY7	904 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	RNF122	Q9H9V4	155 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	MED11	Q9P086	117 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		11.33	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	CAD	P27708	2225 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	OR2M5	A3KFT3	312 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931		H3BML4	177 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	C16orf97	H3BN30	126 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	FADS1	O60427	444 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	PLOD3	O60568	738 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	TNFRSF21	O75509	655 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	INHBA	P08476	426 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	CD8B	P10966	210 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	HK1	P19367	917 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	PHB	P35232	272 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	HSD17B3	P37058	310 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	KCNJ5	P48544	419 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	PTH2R	P49190	550 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	HTR6	P50406	440 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	PSG6	Q00889	435 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	CLC	Q05315	142 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	STX5	Q13190	355 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	PON3	Q15166	354 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	GUSBP1	Q15486	140 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	APIP	Q96GX9	242 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	PAFAH2	Q99487	392 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	FUT8	Q9BYC5	575 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	ACPT	Q9BZG2	426 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		11.32	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	AQP8	O94778	261 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	THBD	P07204	575 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	COL6A2	P12110	1019 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	HSD3B1	P14060	373 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	HSD3B2	P26439	372 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	PSPH	P78330	225 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	UNC50	Q53HI1	259 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	EBPL	Q9BY08	206 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	GSX2	Q9BZM3	304 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	SENP1	Q9P0U3	644 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF175	Q9Y473	711 aa		11.31	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	KLF4	O43474	513 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	SUPT7L	O94864	414 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	KRT6A	P02538	564 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	KRT6B	P04259	564 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	TBXA2R	P21731	343 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	KRT6C	P48668	564 aa		11.3	□□□□□ -0.6
LETMD1-231	ENST00000551931	SERPINB9	P50453	376 aa		11.3	□□□□□ -0.6

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