RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526386.5

UBASH3B-203, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 553 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-203ENST00000526386 ZNF136P52737 540 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 CDH12P55289 794 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 ISL1P61371 349 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 PSG6Q00889 435 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 SPIBQ01892 262 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 IL18R1Q13478 541 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 MAPK14Q16539 360 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 ZNF311Q5JNZ3 666 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 COLEC12Q5KU26 742 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 DCST2Q5T1A1 773 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 RNF220Q5VTB9 566 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 ZNF691Q5VV52 312 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 MLIPQ5VWP3 458 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 VRK2Q86Y07 508 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 ZNF619Q8N2I2 560 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 PARP8Q8N3A8 854 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 CLIP4Q8N3C7 705 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 OR10G2Q8NGC3 310 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 OR6T1Q8NGN1 323 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 OR52P1PQ8NH57 321 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 NR4A3Q92570 626 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 DIO2Q92813 273 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 FKBP10Q96AY3 582 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 CCDC74BQ96LY2 380 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 RBCK1Q9BYM8 510 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 EVA1AQ9H8M9 152 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 RLIMQ9NVW2 624 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 GMEB2Q9UKD1 530 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 WDR45Q9Y484 360 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 MAU2Q9Y6X3 613 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 SH3PXD2BA1X283 911 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 D6RAR5 112 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 M0R3H8 397 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 FAAHO00519 579 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 PRAMEF2O60811 474 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 LRP3O75074 770 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 CCNB2O95067 398 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 LYPD3O95274 346 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 TIAF1O95411 115 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 IGKV1D-16P01601 117 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 DBIP07108 87 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 GP1BAP07359 652 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 CT45A8P0DMV1 189 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 CT45A9P0DMV2 189 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 FGF5P12034 268 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 NID1P14543 1247 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 DRD5P21918 477 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 ALAS2P22557 587 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 ACP1P24666 158 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 EPHA2P29317 976 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 GRK6P43250 576 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 PPICP45877 212 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 ALDH3B2P48448 385 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 SLC37A1P57057 533 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 PLAURQ03405 335 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 NPRL3Q12980 569 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 KEAP1Q14145 624 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 SEC23BQ15437 767 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 ZNF141Q15928 474 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 CT45A2Q5DJT8 189 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 C6orf141Q5SZD1 244 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 CCNJQ5T5M9 372 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 KRT80Q6KB66 452 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 NPSR1Q6W5P4 371 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 ZAR1Q86SH2 424 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa6.59□□□□□ -1.35
UBASH3B-203ENST00000526386 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms