RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523636.5

PABPC1-223, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 5

Gene PABPC1, Length 818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-223	ENST00000523636	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636		Q96MF0	132 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	PSMB7	Q99436	277 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	CD180	Q99467	661 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	CGREF1	Q99674	301 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	AGPAT1	Q99943	283 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	INPP5K	Q9BT40	448 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	NFU1	Q9UMS0	254 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	MED12	Q93074	2177 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	IQCF5	A8MTL0	148 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636		M0QYG6	137 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	PSMD11	O00231	422 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	TOX	O94900	526 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	GPANK1	O95872	356 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	RAF1	P04049	648 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	RLN1	P04808	185 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	FGF1	P05230	155 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	CALCB	P10092	127 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	RPA2	P15927	270 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	TUBG1	P23258	451 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	PKLR	P30613	574 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	GTF2H1	P32780	548 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	SERPINB6	P35237	376 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	CETN2	P41208	172 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	CYP2J2	P51589	502 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ARSF	P54793	590 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	TSPAN5	P62079	268 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	EFNB1	P98172	346 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	GTF2B	Q00403	316 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	GALK2	Q01415	458 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	IL18	Q14116	193 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	SPCS2	Q15005	226 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ACOT1	Q86TX2	421 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	TRABD2A	Q86V40	505 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	LRRC6	Q86X45	466 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	OCC1	Q8TAD7	63 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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