RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 LINC00477Q96M19 166 aa1.24□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP1.24□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM149AA5PLN7 773 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 A8MUA0 341 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 PES1O00541 588 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 B4GALT2O60909 372 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 ECDO95905 644 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 PGK2P07205 417 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 GSTA1P08263 222 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 ADRB3P13945 408 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 CASP2P42575 452 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 MNAT1P51948 309 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 STX1AQ16623 288 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPAT3Q53EU6 434 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 HMGN2P46Q86SG4 172 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 PARGQ86W56 976 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 Q8NFD4 153 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM210BQ96KR6 192 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPIN2AQ99865 258 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 NTMT1Q9BV86 223 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACPTQ9BZG2 426 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 NAPBQ9H115 298 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 GANQ9H2C0 597 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 PNPLA3Q9NST1 481 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 VPS18Q9P253 973 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 LHX3Q9UBR4 397 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 FZR1Q9UM11 496 aa1.23□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 DOCK9Q9BZ29 2069 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 PSMB11A5LHX3 300 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 GJE1A6NN92 205 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 PDLIM1O00151 329 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF264O43296 627 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 SDC3O75056 442 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPAG7O75391 227 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 CBR3O75828 277 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 GLCEO94923 617 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 HPDP32754 393 aaPredicted RBP1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 APOC4P55056 127 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 MTTPP55157 894 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACTA2P62736 377 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACTC1P68032 377 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNJ11Q14654 390 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 AANATQ16613 207 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 CD164L2Q6UWJ8 174 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARSKQ6UWY0 536 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM126BQ8IUX1 230 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 MYOCDQ8IZQ8 938 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 NUP93Q8N1F7 819 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARRDC1Q8N5I2 433 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM252Q8N6L7 170 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF740Q8NDX6 193 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM46BQ96A09 425 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 AP2M1Q96CW1 435 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNF185Q96GF1 192 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 ERO1AQ96HE7 468 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 GBP5Q96PP8 586 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 TXN2Q99757 166 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR10A4Q9H209 315 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANKEF1Q9NU02 776 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 VPS54Q9P1Q0 977 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR1A1Q9P1Q5 309 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 FBXL5Q9UKA1 691 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 WIF1Q9Y5W5 379 aa1.22□□□□□ -2.21
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRAV34A0A0B4J273 112 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 C19orf81C9J6K1 198 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 SH3BP5O60239 455 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP1.21□□□□□ -2.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 DCNP07585 359 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 ADORA2BP29275 332 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 BTDP43251 543 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP1.21□□□□□ -2.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 NPRL3Q12980 569 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 NSDHLQ15738 373 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 CYP51A1Q16850 503 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 C5orf47Q569G3 176 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 NHLRC2Q8NBF2 726 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 STARD8Q92502 1023 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM162AQ96A26 154 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 RMI2Q96E14 147 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 TSNARE1Q96NA8 513 aa1.21□□□□□ -2.22
RNU6-277P-201ENST00000516272 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms