RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511978.5

MATR3-218, Transcript of matrin 3, human

TSL 3

Gene MATR3, Length 573 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-218	ENST00000511978	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	CCDC188	H7C350	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	AP3B1	O00203	1094 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	AVIL	O75366	819 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	WISP2	O76076	250 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	TUBB	P07437	444 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	PRSS56	P0CW18	603 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	IDS	P22304	550 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	PSMA3	P25788	255 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	ALDH4A1	P30038	563 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	FOXN2	P32314	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	PRLHR	P49683	370 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	MFAP4	P55083	255 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	OR1D5	P58170	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	CDK16	Q00536	496 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	DR1	Q01658	176 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	ACVR1	Q04771	509 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	DMPK	Q09013	629 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	ARL16	Q0P5N6	197 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	PTK6	Q13882	451 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	NFE2L1	Q14494	772 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	KIR2DS5	Q14953	304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	ISX	Q2M1V0	245 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	IYD	Q6PHW0	289 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	PACS1	Q6VY07	963 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	AMZ2	Q86W34	360 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	SLC5A8	Q8N695	610 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	AVL9	Q8NBF6	648 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	OR2L2	Q8NH16	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	OR10G6	Q8NH81	332 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	SLCO2A1	Q92959	643 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	PEX13	Q92968	403 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63	3e-7	■■■□□ 16.8
MATR3-218	ENST00000511978	MOAP1	Q96BY2	351 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	SGF29	Q96ES7	293 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	DACH2	Q96NX9	599 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	SERPINB12	Q96P63	405 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	NEURL2	Q9BR09	285 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	TREX1	Q9NSU2	369 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	MGAT4D	A6NG13	374 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	TMEM178B	H3BS89	294 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	ZW10	O43264	779 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	B4GAT1	O43505	415 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	DUX1	O43812	170 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	OR1I1	O60431	355 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	AP2A2	O94973	939 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	CPNE6	O95741	557 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	PROS1	P07225	676 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	MLN	P12872	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	AMD1	P17707	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	NMBR	P28336	390 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	CD1C	P29017	333 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	CASQ1	P31415	396 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	NSG1	P42857	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	SLC15A1	P46059	708 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	CAPZB	P47756	277 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	NPY2R	P49146	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	PLIN5	Q00G26	463 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	PRKG2	Q13237	762 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	ITIH4	Q14624	930 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-218	ENST00000511978	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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