RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 MARK4Q96L34 752 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 GPR137Q96N19 417 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 PHF12Q96QT6 1004 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 TAAR6Q96RI8 345 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 HES7Q9BYE0 225 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 UBQLN4Q9NRR5 601 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 GPATCH2Q9NW75 528 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 LIPT1Q9Y234 373 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 KALRNO60229 2985 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A1W2PP18 115 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 NPIPA5E9PKD4 350 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 SCDO00767 359 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 ICOSLGO75144 302 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 UGT2B11O75310 529 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 CBR3O75828 277 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 GPR85P60893 370 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 PHC1P78364 1004 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 HPCAP84074 193 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 DUSP5Q16690 384 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 SAXO2Q658L1 398 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 GFRALQ6UXV0 394 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 C16orf62Q7Z3J2 963 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 TTTY12Q9BZ98 90 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 CALML5Q9NZT1 146 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 NPIPA1Q9UND3 350 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A096LPI6 279 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 ANGPT2O15123 496 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 SUSD5O60279 629 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 HCN1O60741 890 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 STX11O75558 287 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 GLSO94925 669 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 KCNK2O95069 426 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 ACP2P11117 423 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 MSX1P28360 303 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 EVI2BP34910 448 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 ST13P50502 369 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 C17orf67Q0P5P2 114 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 TIGD2Q4W5G0 525 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 PRAMEF20Q5VT98 475 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 TIGD3Q6B0B8 471 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 OR5AK3PQ8NH89 298 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 OR7D2Q96RA2 312 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 LDAHQ9H6V9 325 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 PTGES2Q9H7Z7 377 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 ACKR4Q9NPB9 350 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 DEPPQ9NTK1 212 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 NDUFAF1Q9Y375 327 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 WIF1Q9Y5W5 379 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A1B0GUH1 482 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A1W2PQD3 144 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 OR14I1A6ND48 311 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 BBIP1A8MTZ0 92 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 EVPLLA8MZ36 301 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 NR5A2O00482 541 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 SNPHO15079 494 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 UTS2O95399 124 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 CBX6O95503 412 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 NPPAP01160 153 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 CYP4B1P13584 511 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 TBXA2RP21731 343 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 LSP1P33241 339 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 RFX3P48380 749 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 DNASE1L1P49184 302 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 GNGT1P63211 74 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 KCNC4Q03721 635 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 FOXO1Q12778 655 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 FADDQ13158 208 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 STX5Q13190 355 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 GANABQ14697 944 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP13.32□□□□□ -0.281e-13■■■■□ 22.1
SH3BP2-208ENST00000504294 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 COLEC12Q5KU26 742 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 DCST2Q5T1A1 773 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 MTFR2Q6P444 385 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 SPATA21Q7Z572 469 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 OR4N2Q8NGD1 307 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 OR9I1Q8NGQ6 314 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 PIK3R3Q92569 461 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 GTF2H4Q92759 462 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 CDS1Q92903 461 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 C16orf58Q96GQ5 468 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 NODALQ96S42 347 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 YIPF4Q9BSR8 244 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
SH3BP2-208ENST00000504294 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms