RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-215ENST00000498284 SCGB2A2Q13296 93 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-215ENST00000498284 ADPRMQ3LIE5 342 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-215ENST00000498284 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-215ENST00000498284 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-215ENST00000498284 ARSKQ6UWY0 536 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-215ENST00000498284 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-215ENST00000498284 PAQR9Q6ZVX9 377 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-215ENST00000498284 Q7L0L9 218 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-215ENST00000498284 LPCAT2Q7L5N7 544 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-215ENST00000498284 NAXDQ8IW45 347 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-215ENST00000498284 RFESDQ8TAC1 157 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-215ENST00000498284 CRYGNQ8WXF5 182 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-215ENST00000498284 TADA1Q96BN2 335 aa3.34□□□□□ -1.87
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PTPRK-215ENST00000498284 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-215ENST00000498284 TRPV5Q9NQA5 729 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-215ENST00000498284 POLE3Q9NRF9 147 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-215ENST00000498284 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-215ENST00000498284 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-215ENST00000498284 C1orf123Q9NWV4 160 aa3.34□□□□□ -1.87
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PTPRK-215ENST00000498284 KLRF1Q9NZS2 232 aa3.34□□□□□ -1.87
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PTPRK-215ENST00000498284 ATP6V1HQ9UI12 483 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-215ENST00000498284 DHRS7Q9Y394 339 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-215ENST00000498284 NCAPD2Q15021 1401 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRK-215ENST00000498284 CCDC88BA6NC98 1476 aa3.34□□□□□ -1.88
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PTPRK-215ENST00000498284 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
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PTPRK-215ENST00000498284 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
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PTPRK-215ENST00000498284 TYROBPO43914 113 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRK-215ENST00000498284 AK1P00568 194 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRK-215ENST00000498284 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
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PTPRK-215ENST00000498284 KRTAP5-9P26371 169 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRK-215ENST00000498284 TRPC1P48995 793 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRK-215ENST00000498284 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRK-215ENST00000498284 PPP1R3AQ16821 1122 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRK-215ENST00000498284 MS4A13Q5J8X5 152 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF562Q6V9R5 426 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRK-215ENST00000498284 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRK-215ENST00000498284 HSCBQ8IWL3 235 aa3.33□□□□□ -1.88
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PTPRK-215ENST00000498284 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
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PTPRK-215ENST00000498284 CHMP2BQ9UQN3 213 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRK-215ENST00000498284 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
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PTPRK-215ENST00000498284 WASH3PC4AMC7 463 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRK-215ENST00000498284 SAP18O00422 153 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
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PTPRK-215ENST00000498284 ZIC1Q15915 447 aa3.32□□□□□ -1.88
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PTPRK-215ENST00000498284 MARC1Q5VT66 337 aa3.32□□□□□ -1.88
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PTPRK-215ENST00000498284 AFTPHQ6ULP2 937 aa3.32□□□□□ -1.88
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PTPRK-215ENST00000498284 ZBED8Q8IZ13 594 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRK-215ENST00000498284 ZBTB44Q8NCP5 570 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRK-215ENST00000498284 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRK-215ENST00000498284 ART4Q93070 314 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRK-215ENST00000498284 TIGARQ9NQ88 270 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRK-215ENST00000498284 SENP1Q9P0U3 644 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRK-215ENST00000498284 MBD2Q9UBB5 411 aa3.32□□□□□ -1.88
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