RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492895.1

ANKRD28-211, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-211ENST00000492895 TMEM68Q96MH6 324 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 IL17FQ96PD4 163 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 CCM2Q9BSQ5 444 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 DESI2Q9BSY9 194 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 HAUS8Q9BT25 410 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 TMEM121Q9BTD3 319 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 NUDT9Q9BW91 350 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 NLNQ9BYT8 704 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 OSBPL8Q9BZF1 889 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 RAB33BQ9H082 229 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 COG4Q9H9E3 785 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 VPS37BQ9H9H4 285 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM60AQ9NP50 221 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 TXLNGQ9NUQ3 528 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 ABCF3Q9NUQ8 709 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 SMOXQ9NWM0 555 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 SPHK1Q9NYA1 384 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 GPR83Q9NYM4 423 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 AASSQ9UDR5 926 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 POMT2Q9UKY4 750 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 PRSS21Q9Y6M0 314 aa2.99□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 NUP205Q92621 2012 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 CSPG4Q6UVK1 2322 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 A0A087X0M5 115 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 A0A1B0GX30 115 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 KRT87PA6NCN2 255 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 IQCF5A8MTL0 148 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 SOCS6O14544 535 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC16A5O15375 505 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 HCRTR1O43613 425 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 PAGE4O60829 102 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 LDB3O75112 727 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 TIPRLO75663 272 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 GAS8O95995 478 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 F10P00742 488 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 FTH1P02794 183 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 ALPPP05187 535 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 CYC1P08574 325 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 RAB40ALP0C0E4 278 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 OR56A5P0C7T3 313 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 ETS1P14921 441 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 MAGP20916 626 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 MAOAP21397 527 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 CHMP24386 653 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 MCM3P25205 808 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 MT3P25713 68 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 MSNP26038 577 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 SHMT2P34897 504 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 RORAP35398 523 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 HADHAP40939 763 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 GRIA1P42261 906 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 CASP2P42575 452 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 BDKRB1P46663 353 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 OR1D4P47884 311 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 PRLHRP49683 370 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 DCDP81605 110 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 CACNG1Q06432 222 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 DLG1Q12959 904 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 SNX1Q13596 522 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 OASLQ15646 514 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 ZIC1Q15915 447 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 CTF1Q16619 201 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 TAZQ16635 292 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 PARP6Q2NL67 630 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 GPR33Q49SQ1 333 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 DCAF10Q5QP82 559 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 SIGIRRQ6IA17 410 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 C11orf63Q6NUN7 778 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 SPESP1Q6UW49 350 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 RAD9BQ6WBX8 426 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 LINC00696Q6ZRV3 163 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 PEX26Q7Z412 305 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 RAB43Q86YS6 212 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 IQCKQ8N0W5 287 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 KRT222Q8N1A0 295 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 ZADH2Q8N4Q0 377 aa2.98□□□□□ -1.93
ANKRD28-211ENST00000492895 TC2NQ8N9U0 490 aa2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms