RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CRABP1P29762 137 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 BDKRB2P30411 391 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PITPNBP48739 271 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 RAP2BP61225 183 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 DGCR2P98153 550 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ABHD18Q0P651 414 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 DHCR24Q15392 516 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 C2orf68Q2NKX9 166 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 MEDAGQ5VYS4 303 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 MZT2AQ6P582 158 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM71Q6P5X7 295 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 UQCC3Q6UW78 93 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 LAPTM4BQ86VI4 370 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF614Q8N883 585 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 C14orf79Q96F83 325 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 NFKBIZQ9BYH8 718 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 WDR13Q9H1Z4 485 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC38A1Q9H2H9 487 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PIGMQ9H3S5 423 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 XKR8Q9H6D3 395 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 COX16Q9P0S2 106 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ECI2O75521 394 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 IGHA2P01877 340 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 IDSP22304 550 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 AKAP5P24588 427 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC6A4P31645 630 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 IRS1P35568 1242 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SOX18P35713 384 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 RPL38P63173 70 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TNFRSF9Q07011 255 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 C1DQ13901 141 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ABRAXAS2Q15018 415 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 C18orf63Q68DL7 685 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CILP2Q8IUL8 1156 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CFAP206Q8IYR0 622 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF561Q8N587 486 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SPICQ8N5J4 248 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 C7orf31Q8N865 590 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR5M3Q8NGP4 307 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR6B3Q8NGW1 331 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR6K3Q8NGY3 331 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SCLYQ96I15 445 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 FCRL5Q96RD9 977 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CLCC1Q96S66 551 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPR61Q9BZJ8 451 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR10A4Q9H209 315 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM231Q9H6L2 316 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 WDR26Q9H7D7 661 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SIP14410 1827 aa6.49□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 C5orf58C9J3I9 102 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 AP4M1O00189 453 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC25A12O75746 678 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 YIF1AO95070 293 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 KCNK5O95279 499 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 AGR2O95994 175 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 RHOP08100 348 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 RFX3P48380 749 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CDH12P55289 794 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 GAMTQ14353 236 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF667Q5HYK9 610 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 LRIF1Q5T3J3 769 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 IDNKQ5T6J7 187 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 CLEC2AQ6UVW9 174 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 LHFPL3Q86UP9 236 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PTOV1Q86YD1 416 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 OR51Q1Q8NH59 317 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM151AQ8WW52 585 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZFP42Q96MM3 310 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 TSSK6Q9BXA6 273 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRM3Q9NNZ6 103 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 ACKR4Q9NPB9 350 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 SPG21Q9NZD8 308 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 MED16Q9Y2X0 877 aa6.48□□□□□ -1.37
CACNA2D3-210ENST00000490478 GSAPA4D1B5 854 aa6.48□□□□□ -1.37
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