RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, human

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCL20-204	ENST00000489160	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	RNF222	A6NCQ9	220 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	MEI4	A8MW99	385 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	SOCS3	O14543	225 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	ARPC3	O15145	178 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	OR1F1	O43749	312 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	ANXA9	O76027	345 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	ZNF883	P0CG24	379 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	PNMT	P11086	282 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	SELE	P16581	610 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	MX1	P20591	662 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	UQCRC2	P22695	453 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	GRIA1	P42261	906 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	FNTA	P49354	379 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	RBBP4	Q09028	425 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	IFT88	Q13099	833 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	LY6D	Q14210	128 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	CAMK4	Q16566	473 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	DOK6	Q6PKX4	331 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160		Q6ZRG5	221 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160		Q7L0L9	218 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160		Q8NBF4	154 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	LRRC15	Q8TF66	581 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	P3H4	Q92791	437 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	C18orf12	Q96KH6	178 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	OMD	Q99983	421 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	SGK2	Q9HBY8	427 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	CDH9	Q9ULB4	789 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	FZR1	Q9UM11	496 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160		A0A0J9YWU9	116 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	TTC26	A0AVF1	554 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	ASB14	A6NK59	587 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	WRB	O00258	174 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	LRRTM2	O43300	516 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	CACNG3	O60359	315 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	FOSL2	P15408	326 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	GLRA1	P23415	457 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	SYK	P43405	635 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	HTR5A	P47898	357 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	VEGFC	P49767	419 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	MAPK6	Q16659	721 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	CARD17	Q5XLA6	110 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	METTL7B	Q6UX53	244 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	SYT14	Q8NB59	555 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	ACCS	Q96QU6	501 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	DCTPP1	Q9H773	170 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	EXO5	Q9H790	373 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCL20-204	ENST00000489160	NMUR1	Q9HB89	426 aa		4.11	□□□□□ -1.75

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