RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 NDRG3Q9UGV2 375 aa18.27■□□□□ 0.52
ACTB-212ENST00000484841 MID2Q9UJV3 735 aa18.27■□□□□ 0.52
ACTB-212ENST00000484841 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
ACTB-212ENST00000484841 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 G3V2L1 256 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 SEC22BO75396 215 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 RAF1P04049 648 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 UROSP10746 265 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 ZNF708P17019 499 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 HK1P19367 917 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 GPC1P35052 558 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 CPOXP36551 454 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 STX5Q13190 355 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 GANABQ14697 944 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 BCL2A1Q16548 175 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 FAM71E1Q6IPT2 247 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 NOXRED1Q6NXP6 359 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 FRMD7Q6ZUT3 714 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 TRIM46Q7Z4K8 759 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 DACH2Q96NX9 599 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 PPCSQ9HAB8 311 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 TAS2R7Q9NYW3 318 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 CLCF1Q9UBD9 225 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 PACSIN3Q9UKS6 424 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 EMCNQ9ULC0 261 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 ABCG2Q9UNQ0 655 aa18.26■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 SMIM23A6NLE4 172 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 SLC28A1O00337 649 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 COPEO14579 308 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 RGS14O43566 566 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP18.25■□□□□ 0.513e-14■■■■□ 20.3
ACTB-212ENST00000484841 PROCP04070 461 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 CPA3P15088 417 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 CLDN18P56856 261 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 DNAJB13P59910 316 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 PAMR1Q6UXH9 720 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 MZB1Q8WU39 189 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 ALPK1Q96QP1 1244 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 TXLNGYQ9BZA5 131 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 GLIPR2Q9H4G4 154 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 MED11Q9P086 117 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 MPDZO75970 2070 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 UQCRHLA0A096LP55 91 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 SH3D21A4FU49 640 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 SLC22A20A6NK97 555 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 TTC36A6NLP5 189 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 LINC01387J3KSC0 135 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 UPK1AO00322 258 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 ZIC3O60481 467 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 KCNH1O95259 989 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 CHEK2O96017 543 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 CRHP06850 196 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 CRHR1P34998 444 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 GAS1P54826 345 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 PLXDC2Q6UX71 529 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 HOMEZQ8IX15 550 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 OR2L13Q8N349 312 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 OR2M3Q8NG83 312 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 ZFP28Q8NHY6 868 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 ELP4Q96EB1 424 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 AMDHD1Q96NU7 426 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 STOML1Q9UBI4 398 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 MED12LQ86YW9 2145 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 PLIN3O60664 434 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 DIAPH2O60879 1101 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 IL33O95760 270 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 KLK2P20151 261 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 POU4F3Q15319 338 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 LIPMQ5VYY2 423 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 FADS6Q8N9I5 356 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 DUSP19Q8WTR2 217 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 RNF138Q8WVD3 245 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 MBD6Q96DN6 1003 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 PIGQQ9BRB3 760 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 TMUB1Q9BVT8 246 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 HHATLQ9HCP6 504 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 OXSMQ9NWU1 459 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 C1orf109Q9NX04 203 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 FIS1Q9Y3D6 152 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 MED12Q93074 2177 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 A0A1W2PNV4 684 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 A8MXE2 369 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 H3BML4 177 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 MSTNO14793 375 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 PDPK1O15530 556 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 SEC14L5O43304 696 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 HCRTR2O43614 444 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 FADS1O60427 444 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 TGM6O95932 706 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTB-212ENST00000484841 PRPS2P11908 318 aa18.22■□□□□ 0.51
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