RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478365.1

DDX39B-218, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 439 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-218ENST00000478365 COL21A1Q96P44 957 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 MS4A4EQ96PG1 132 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 SORT1Q99523 831 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 ITPAQ9BY32 194 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 TTTY12Q9BZ98 90 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 GLIPR2Q9H4G4 154 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 METTL7AQ9H8H3 244 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 MANSC1Q9H8J5 431 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 FOLH1BQ9HBA9 442 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 ACKR4Q9NPB9 350 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 IL20Q9NYY1 176 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 PCDHGB4Q9UN71 923 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 NPIPA1Q9UND3 350 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 ABCG2Q9UNQ0 655 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 OSGIN2Q9Y236 505 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 ZNF835Q9Y2P0 537 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 COL12A1Q99715 3063 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 CENPEQ02224 2701 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 A0A1B0GVC2 190 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 A0A1B0GVG6 124 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 A0A1W2PRB8 838 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 A0A1W2PS29 197 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 PRAMEF25A6NGN4 478 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 FIGNL2A6NMB9 653 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 FAM25EA8MYX2 175 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 AQP7O14520 342 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 EMC8O43402 210 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 AKAP10O43572 662 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 ITM2AO43736 263 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 REM1O75628 298 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 ATP6AP2O75787 350 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 KCNH1O95259 989 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 TGDSO95455 350 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 IGHG3P01860 377 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 CCL3P10147 92 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 AGAP20933 346 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 TACR1P25103 407 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 MST1P26927 711 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 ARRB2P32121 409 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 PTGS2P35354 604 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 PTGER4P35408 488 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 MC3RP41968 323 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 CA7P43166 264 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 SMSP52788 366 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 WDR4P57081 412 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 GPR85P60893 370 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 PMP22Q01453 160 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 OCRLQ01968 901 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 DUSP2Q05923 314 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 FOXO1Q12778 655 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 HSPB3Q12988 150 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 SLC10A1Q14973 349 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 SMUG1Q53HV7 270 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 ANXA8L1Q5VT79 327 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 TMEM211Q6ICI0 200 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 TMEM107Q6UX40 140 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 CPLX4Q7Z7G2 160 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 SPPL2CQ8IUH8 684 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 OR7G2Q8NG99 324 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 PSMA8Q8TAA3 256 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 MGARPQ8TDB4 240 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 KAT2AQ92830 837 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 TESCQ96BS2 214 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 SARAFQ96BY9 339 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 COQ8BQ96D53 544 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 EGLN2Q96KS0 407 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 C7orf26Q96N11 449 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 ZBTB18Q99592 522 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 OSBPL11Q9BXB4 747 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 ANGPTL4Q9BY76 406 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 DPY30Q9C005 99 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 SDHAF3Q9NRP4 125 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 RHBDL2Q9NX52 303 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 GIN1Q9NXP7 522 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 LRCH1Q9Y2L9 728 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 EML6Q6ZMW3 1958 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 WIPF3A6NGB9 483 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 E9PLN8 166 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-218ENST00000478365 UPK1AO00322 258 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms