RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477529.1

SRRT-210, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-210ENST00000477529 GAS1P54826 345 aa12.86□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 WNT3P56703 355 aa12.86□□□□□ -0.35
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SRRT-210ENST00000477529 HBA1P69905 142 aa12.86□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 PRR5P85299 388 aa12.86□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 ADORA2A-AS1P86434 159 aa12.86□□□□□ -0.35
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SRRT-210ENST00000477529 SLC10A1Q14973 349 aa12.86□□□□□ -0.35
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SRRT-210ENST00000477529 CEP70Q8NHQ1 597 aa12.86□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
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SRRT-210ENST00000477529 C17orf51A8MQB3 221 aa12.85□□□□□ -0.35
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SRRT-210ENST00000477529 NPIPA3F8WFD2 350 aa12.85□□□□□ -0.35
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SRRT-210ENST00000477529 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 C16orf58Q96GQ5 468 aa12.85□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 TEX37Q96LM6 180 aa12.85□□□□□ -0.35
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SRRT-210ENST00000477529 PNPLA3Q9NST1 481 aa12.85□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 GPATCH2Q9NW75 528 aa12.85□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 ZNF446Q9NWS9 450 aa12.85□□□□□ -0.35
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SRRT-210ENST00000477529 SNX8Q9Y5X2 465 aa12.85□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 E9PBE3 544 aa12.84□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 E9PLN8 166 aa12.84□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
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SRRT-210ENST00000477529 KIR3DL1P43629 444 aa12.84□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 RFX3P48380 749 aa12.84□□□□□ -0.35
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SRRT-210ENST00000477529 PHC1P78364 1004 aa12.84□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 TP53BP2Q13625 1128 aa12.84□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 DPY19L1Q2PZI1 675 aa12.84□□□□□ -0.35
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SRRT-210ENST00000477529 OR56A1Q8NGH5 318 aa12.84□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 OR5AK3PQ8NH89 298 aa12.84□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 GPR151Q8TDV0 419 aa12.84□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
SRRT-210ENST00000477529 SLC9A6Q92581 669 aa12.84□□□□□ -0.35
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