RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 LANCL2Q9NS86 450 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 KLHL28Q9NXS3 571 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 MAT2BQ9NZL9 334 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 HCN3Q9P1Z3 774 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 SLC13A4Q9UKG4 626 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
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SHQ1-207ENST00000475558 SYT5O00445 386 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 HMGN4O00479 90 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 GNGT2O14610 69 aa6.52□□□□□ -1.37
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SHQ1-207ENST00000475558 DNAJB6O75190 326 aa6.52□□□□□ -1.37
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SHQ1-207ENST00000475558 NKX2-2O95096 273 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 BAG2O95816 211 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 B3GALT4O96024 378 aa6.52□□□□□ -1.37
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SHQ1-207ENST00000475558 ETFAP13804 333 aa6.52□□□□□ -1.37
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SHQ1-207ENST00000475558 ATP6V1C1P21283 382 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 MC3RP41968 323 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 CD97P48960 835 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 OR4D2P58180 307 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
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SHQ1-207ENST00000475558 KLRB1Q12918 225 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 DUSP8Q13202 625 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 SELPLGQ14242 412 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
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SHQ1-207ENST00000475558 FAM219BQ5XKK7 198 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
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SHQ1-207ENST00000475558 OR4N5Q8IXE1 308 aa6.52□□□□□ -1.37
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SHQ1-207ENST00000475558 PEX5LQ8IYB4 626 aa6.52□□□□□ -1.37
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SHQ1-207ENST00000475558 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 LINC00471Q8N535 108 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 SLC15A4Q8N697 577 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 PACRGLQ8N7B6 248 aa6.52□□□□□ -1.37
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SHQ1-207ENST00000475558 GPR151Q8TDV0 419 aa6.52□□□□□ -1.37
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SHQ1-207ENST00000475558 PROX1Q92786 737 aa6.52□□□□□ -1.37
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SHQ1-207ENST00000475558 HSPBAP1Q96EW2 488 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 SLC35A4Q96G79 324 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 ABHD17AQ96GS6 310 aa6.52□□□□□ -1.37
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SHQ1-207ENST00000475558 CSF3RQ99062 836 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 ULBP3Q9BZM4 244 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 SAP130Q9H0E3 1048 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 OR10A5Q9H207 317 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 OR51I1Q9H343 314 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 IKZF5Q9H5V7 419 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 IL1RAPQ9NPH3 570 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 SLC6A13Q9NSD5 602 aa6.52□□□□□ -1.37
SHQ1-207ENST00000475558 C5AR2Q9P296 337 aa6.52□□□□□ -1.37
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