RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 MMP20O60882 483 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 STATHP02808 62 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 ICAM2P13598 275 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 GPR4P46093 362 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 HSF2Q03933 536 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 C1orf94Q6P1W5 598 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 RTL4Q6ZR62 310 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 C11orf96Q7Z7L8 435 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 LRRTM4Q86VH4 590 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 SIAH3Q8IW03 269 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 CFAP206Q8IYR0 622 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 OR4Q3Q8NH05 313 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 GIMAP1Q8WWP7 306 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 SMPDL3AQ92484 453 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 DPAGT1Q9H3H5 408 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM5Q9Y2B1 443 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 ATG13O75143 517 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 C1orf105O95561 183 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 PITPNBP48739 271 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 DGCR2P98153 550 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 PUDPQ08623 228 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 FZD5Q13467 585 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 CAMK2DQ13557 499 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 KIAA1211LQ6NV74 962 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 ARL9Q6T311 187 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 LIPIQ6XZB0 460 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 MS4A15Q8N5U1 240 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 OR2T35Q8NGX2 323 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC5A11Q8WWX8 675 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 PIGKQ92643 395 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 CHFRQ96EP1 664 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 KLHL15Q96M94 604 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 ZSWIM3Q96MP5 696 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC38A2Q96QD8 506 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 EFCAB11Q9BUY7 163 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 MED20Q9H944 212 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 CFAP97Q9P2B7 532 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 CHST2Q9Y4C5 530 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 USP34Q70CQ2 3546 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC5A10A0PJK1 596 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 IRGMA1A4Y4 181 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 GLOD5A6NK44 160 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 H3BUI4 141 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 GPR171O14626 319 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 CKMP06732 381 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 SELENOPP49908 381 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 NXPE4Q6UWF7 544 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 SYT9Q86SS6 491 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC9B2Q86UD5 537 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 IZUMO1Q8IYV9 350 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 FTMTQ8N4E7 242 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 OVCA2Q8WZ82 227 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 LINC00052Q96N35 136 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 OR2M2Q96R28 347 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF649Q9BS31 505 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 CACNG6Q9BXT2 260 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A1W2PPK0 400 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 POM121CA8CG34 1229 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 EFCAB14O75071 495 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 CHRM4P08173 479 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 TAS2R41P59536 307 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC36A2Q495M3 483 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM26DQ5JW98 314 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 ENTPD8Q5MY95 495 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM81Q6P7N7 255 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 SMARCD3Q6STE5 483 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 Q6ZNB5 142 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF527Q8NB42 609 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 POGLUT1Q8NBL1 392 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 OR8K5Q8NH50 307 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 OR5P2Q8WZ92 322 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 ARMC5Q96C12 935 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 NXPE2Q96DL1 559 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 DLL4Q9NR61 685 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 RNF186Q9NXI6 227 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-206ENST00000469947 FLVCR2Q9UPI3 526 aa12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms