RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467080.1

RBM17-208, Transcript of RNA binding motif protein 17, human

TSL 2

Gene RBM17, Length 837 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM17-208	ENST00000467080	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	POLE	Q07864	2286 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	EFCAB7	A8K855	629 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	B4GAT1	O43505	415 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	PIGN	O95427	931 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	EML2	O95834	649 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	DANCR	P0C864	163 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	GCLM	P48507	274 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	ALDH3A2	P51648	485 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	NAGLU	P54802	743 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	OR1D5	P58170	312 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	UBXN1	Q04323	297 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	ACSM1	Q08AH1	577 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	MORF4L2	Q15014	288 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	RAPH1	Q70E73	1250 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	DET1	Q7L5Y6	550 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	ARL10	Q8N8L6	244 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	ART4	Q93070	314 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	NXNL1	Q96CM4	212 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	C19orf60	Q96EN9	201 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	PDXP	Q96GD0	296 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	APMAP	Q9HDC9	416 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	SPAST	Q9UBP0	616 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	FPGT	O14772	594 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	ALOX15B	O15296	676 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	ATP6V0E1	O15342	81 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	OR10H2	O60403	315 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	MOCS3	O95396	460 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	IGLV1-44	P01699	117 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	IGHV4-59	P01825	116 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	ADRB3	P13945	408 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	ADRA2C	P18825	462 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	RABIF	P47224	123 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	PLK1	P53350	603 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	NFE2L1	Q14494	772 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	P2RY6	Q15077	328 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	PMF1	Q6P1K2	205 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	VPS36	Q86VN1	386 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	TIGD4	Q8IY51	512 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	PATE1	Q8WXA2	126 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	STARD8	Q92502	1023 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	EXT2	Q93063	718 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	SPSB1	Q96BD6	273 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	CENPT	Q96BT3	561 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	GIMAP5	Q96F15	307 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	RANBP9	Q96S59	729 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	RUFY1	Q96T51	708 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	MIS12	Q9H081	205 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	CISH	Q9NSE2	258 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM17-208	ENST00000467080	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		4.75	□□□□□ -1.65

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