RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 TTYH2Q9BSA4 534 aa21.86■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 AKTIPQ9H8T0 292 aa21.86■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 RNF6Q9Y252 685 aa21.86■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 ITPR2Q14571 2701 aa21.86■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 CACNA1DQ01668 2161 aa21.85■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 MLC1Q15049 377 aa21.85■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 SMU1Q2TAY7 513 aa21.85■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 CDRT4Q8N9R6 151 aa21.85■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa21.85■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 NUDT8Q8WV74 236 aa21.85■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 MS4A4EQ96PG1 132 aa21.85■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 TIMP4Q99727 224 aa21.85■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 PNPOQ9NVS9 261 aa21.85■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa21.85■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 NTMQ9P121 344 aa21.85■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 HAO1Q9UJM8 370 aa21.85■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa21.85■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 GXYLT2A0PJZ3 443 aa21.84■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 KCNH1O95259 989 aa21.84■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 IL33O95760 270 aa21.84■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 GLI4P10075 376 aa21.84■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 CHRNB4P30926 498 aa21.84■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 EVI2BP34910 448 aa21.84■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 GCKP35557 465 aa21.84■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 PRR5P85299 388 aa21.84■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 CASP8Q14790 479 aa21.84■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 OR5M10Q6IEU7 315 aa21.84■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 ULK2Q8IYT8 1036 aa21.84■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 NATD1Q8N6N6 113 aa21.84■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 OR14L1PQ8NHC6 308 aa21.84■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 RNF138Q8WVD3 245 aa21.84■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 PIK3R3Q92569 461 aa21.84■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 SLC9A6Q92581 669 aa21.84■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 MARVELD3Q96A59 401 aa21.84■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 TLCD1Q96CP7 247 aa21.84■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 COQ8BQ96D53 544 aa21.84■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 NUF2Q9BZD4 464 aa21.84■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 ASIC5Q9NY37 505 aa21.84■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa21.83■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 SCO2O43819 266 aa21.83■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 NKX2-2O95096 273 aa21.83■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 BMP7P18075 431 aa21.83■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 PTGER4P35408 488 aa21.83■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 SLC18A1P54219 525 aa21.83■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 GAS1P54826 345 aa21.83■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 NHSL2Q5HYW2 709 aa21.83■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 VASNQ6EMK4 673 aa21.83■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 RIMKLAQ8IXN7 391 aa21.83■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 FBXO30Q8TB52 745 aa21.83■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 OR5P2Q8WZ92 322 aa21.83■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 DTNBP1Q96EV8 351 aa21.83■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 GIMAP5Q96F15 307 aa21.83■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 UGT2B28Q9BY64 529 aa21.83■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 FLRT3Q9NZU0 649 aa21.83■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 SNX8Q9Y5X2 465 aa21.83■■□□□ 1.09
SMKR1-201ENST00000462322 FADS1O60427 444 aa21.82■■□□□ 1.08
SMKR1-201ENST00000462322 MAP3K8P41279 467 aa21.82■■□□□ 1.08
SMKR1-201ENST00000462322 CLDN8P56748 225 aa21.82■■□□□ 1.08
SMKR1-201ENST00000462322 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SMKR1-201ENST00000462322 MFSD12Q6NUT3 480 aa21.82■■□□□ 1.08
SMKR1-201ENST00000462322 PM20D2Q8IYS1 436 aa21.82■■□□□ 1.08
SMKR1-201ENST00000462322 LILRB4Q8NHJ6 448 aa21.82■■□□□ 1.08
SMKR1-201ENST00000462322 C16orf58Q96GQ5 468 aa21.82■■□□□ 1.08
SMKR1-201ENST00000462322 DUSP26Q9BV47 211 aa21.82■■□□□ 1.08
SMKR1-201ENST00000462322 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SMKR1-201ENST00000462322 OR2B2Q9GZK3 357 aa21.82■■□□□ 1.08
SMKR1-201ENST00000462322 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SMKR1-201ENST00000462322 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa21.82■■□□□ 1.08
SMKR1-201ENST00000462322 FBXL2Q9UKC9 423 aa21.82■■□□□ 1.08
SMKR1-201ENST00000462322 ABCG2Q9UNQ0 655 aa21.82■■□□□ 1.08
SMKR1-201ENST00000462322 CAMK2AQ9UQM7 478 aa21.82■■□□□ 1.08
SMKR1-201ENST00000462322 PKDREJQ9NTG1 2253 aa21.81■■□□□ 1.08
SMKR1-201ENST00000462322 AHRRA9YTQ3 701 aa21.81■■□□□ 1.08
SMKR1-201ENST00000462322 C19orf84I3L1E1 186 aa21.81■■□□□ 1.08
SMKR1-201ENST00000462322 C6orf47O95873 294 aa21.81■■□□□ 1.08
SMKR1-201ENST00000462322 ALOX5P09917 674 aa21.81■■□□□ 1.08
SMKR1-201ENST00000462322 ACP2P11117 423 aa21.81■■□□□ 1.08
SMKR1-201ENST00000462322 COX6B1P14854 86 aa21.81■■□□□ 1.08
SMKR1-201ENST00000462322 SRD5A2P31213 254 aa21.81■■□□□ 1.08
SMKR1-201ENST00000462322 PRIM2P49643 509 aa21.81■■□□□ 1.08
SMKR1-201ENST00000462322 CLK3P49761 638 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SMKR1-201ENST00000462322 DIO3P55073 304 aa21.81■■□□□ 1.08
SMKR1-201ENST00000462322 C21orf58P58505 322 aa21.81■■□□□ 1.08
SMKR1-201ENST00000462322 PGS1Q32NB8 556 aa21.81■■□□□ 1.08
SMKR1-201ENST00000462322 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa21.81■■□□□ 1.08
SMKR1-201ENST00000462322 SLC16A11Q8NCK7 471 aa21.81■■□□□ 1.08
SMKR1-201ENST00000462322 OR4K17Q8NGC6 315 aa21.81■■□□□ 1.08
SMKR1-201ENST00000462322 JADE3Q92613 823 aa21.81■■□□□ 1.08
SMKR1-201ENST00000462322 YIPF4Q9BSR8 244 aa21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.7 ms