RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461520.5

USP54-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP54, Length 1,212 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-208ENST00000461520 NMRAL1Q9HBL8 299 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 MS4A12Q9NXJ0 267 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 OPTCQ9UBM4 332 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 COPS7AQ9UBW8 275 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 MCM8Q9UJA3 840 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 PYCARDQ9ULZ3 195 aa6.69□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 CACNA1CQ13936 2221 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 SYCE1LA8MT33 242 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 SUPT3HB4E1H0 165 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 UBXN8O00124 270 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 WWP2O00308 870 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 RTCAO00442 366 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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USP54-208ENST00000461520 SUPT3HO75486 399 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 FAM155BO75949 473 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 OR6B1O95007 311 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 SLC35E2BP0CK96 405 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 PCNAP12004 261 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 COX7A2P14406 83 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 CAPN3P20807 821 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 CNR1P21554 472 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 CPN2P22792 545 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 SOX3P41225 446 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 PIK3CBP42338 1070 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 SSR2P43308 183 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 MAGEA4P43358 317 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 PLTPP55058 493 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 PPIAP62937 165 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 PLGLB1Q02325 96 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 C2orf54Q08AI8 447 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 DLG1Q12959 904 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 SLMAPQ14BN4 828 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 MPEG1Q2M385 716 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 LIPJQ5W064 366 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 OR4C11Q6IEV9 310 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 GRHL2Q6ISB3 625 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 OPN5Q6U736 354 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 RTL4Q6ZR62 310 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 CMC1Q7Z7K0 106 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 SLC22A16Q86VW1 577 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 OR2M7Q8NG81 312 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 OR7G3Q8NG95 312 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 RHEBL1Q8TAI7 183 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 NUBPLQ8TB37 319 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 FBXO25Q8TCJ0 367 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 ZNF721Q8TF20 911 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 ASB5Q8WWX0 329 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 EXT2Q93063 718 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 SDCCAG3Q96C92 435 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 ART5Q96L15 291 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 FAM173AQ9BQD7 235 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 CENPKQ9BS16 269 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 DUSP26Q9BV47 211 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 TTTY12Q9BZ98 90 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 DEPPQ9NTK1 212 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 MKS1Q9NXB0 559 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 ACOT9Q9Y305 439 aa6.68□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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USP54-208ENST00000461520 H0YIV9 168 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 SAP18O00422 153 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 BCKDKO14874 412 aa6.67□□□□□ -1.34
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USP54-208ENST00000461520 UGDHO60701 494 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 PDE9AO76083 593 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 GLSO94925 669 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 ETHE1O95571 254 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 IGHG3P01860 377 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 IGKV3-11P04433 115 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 P04436 131 aa6.67□□□□□ -1.34
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USP54-208ENST00000461520 PHEXP78562 749 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 PLIN5Q00G26 463 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 TNFRSF17Q02223 184 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 GUCY2DQ02846 1103 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 SLAMF1Q13291 335 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 FAM83EQ2M2I3 478 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 HYAL4Q2M3T9 481 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 ZNF750Q32MQ0 723 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 GXYLT1Q4G148 440 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 PIGGQ5H8A4 983 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 ZDHHC24Q6UX98 284 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 FAM47EQ6ZV65 393 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-208ENST00000461520 GPR180Q86V85 440 aa6.67□□□□□ -1.34
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