RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

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Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 GPX2P18283 190 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 CBLN1P23435 193 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 SRD5A2P31213 254 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 MC4RP32245 332 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 CRHR1P34998 444 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 UBA7P41226 1012 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP-2.28□□□□□ -2.771e-14■■□□□ 14
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SNORD54-201ENST00000459159 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 SEC13P55735 322 aa-2.28□□□□□ -2.77
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SNORD54-201ENST00000459159 LYZP61626 148 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 PRAMEP78395 509 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 HSF1Q00613 529 aa-2.28□□□□□ -2.77
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SNORD54-201ENST00000459159 MORC3Q14149 939 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP-2.28□□□□□ -2.771e-44■■■□□ 15.9
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SNORD54-201ENST00000459159 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 MGAT5BQ3V5L5 792 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 DUSP28Q4G0W2 176 aa-2.28□□□□□ -2.77
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SNORD54-201ENST00000459159 LRRC73Q5JTD7 316 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 C6orf141Q5SZD1 244 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP-2.28□□□□□ -2.77
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SNORD54-201ENST00000459159 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa-2.28□□□□□ -2.77
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SNORD54-201ENST00000459159 TRIB2Q92519 343 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 TTC17Q96AE7 1141 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 MALSU1Q96EH3 234 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 EPSTI1Q96J88 318 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 TWNKQ96RR1 684 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 RNF2Q99496 336 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 P2RX4Q99571 388 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 PIP5K1AQ99755 562 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 MARVELD1Q9BSK0 173 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 C16orf70Q9BSU1 422 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 TTPALQ9BTX7 342 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 TRIM62Q9BVG3 475 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 PTDSS2Q9BVG9 487 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 UBXN6Q9BZV1 441 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 NT5C3AQ9H0P0 336 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 GLT8D2Q9H1C3 349 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 GSTO2Q9H4Y5 243 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 NARFLQ9H6Q4 476 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 JPT2Q9H910 190 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 IFT122Q9HBG6 1241 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 RDH14Q9HBH5 336 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 CNGB3Q9NQW8 809 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 CYP26B1Q9NR63 512 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 NUDT15Q9NV35 164 aa-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP-2.28□□□□□ -2.77
SNORD54-201ENST00000459159 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP-2.28□□□□□ -2.77
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