RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455580.5

PPP1CB-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PPP1CB, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-208ENST00000455580 IL33O95760 270 aa21.8■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 PRPS2P11908 318 aa21.8■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 BMP5P22003 454 aa21.8■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 EVI2BP34910 448 aa21.8■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 SERPINB5P36952 375 aa21.8■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 FRKP42685 505 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF136P52737 540 aa21.8■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 HSPB3Q12988 150 aa21.8■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 RCAN2Q14206 197 aa21.8■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 GALNTL6Q49A17 601 aa21.8■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 CES4AQ5XG92 561 aa21.8■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 ARSKQ6UWY0 536 aa21.8■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa21.8■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 IFNEQ86WN2 208 aa21.8■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF559Q9BR84 538 aa21.8■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 SH3BP4Q9P0V3 963 aa21.8■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 L3MBTL1Q9Y468 752 aa21.8■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 TYROBPO43914 113 aa21.79■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 BCKDHAP12694 445 aa21.79■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 STARP49675 285 aa21.79■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 AAGABQ6PD74 315 aa21.79■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa21.79■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 MREGQ8N565 214 aa21.79■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 OR6Y1Q8NGX8 325 aa21.79■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 CLHC1Q8NHS4 586 aa21.79■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 ZFP28Q8NHY6 868 aa21.79■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 MTERF3Q96E29 417 aa21.79■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 TUBA1CQ9BQE3 449 aa21.79■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 FLRT3Q9NZU0 649 aa21.79■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 NTMQ9P121 344 aa21.79■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 V9GYY5 206 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 TACC2O95359 2948 aa21.79■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 MED12Q93074 2177 aa21.78■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 C17orf51A8MQB3 221 aa21.78■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 SCO2O43819 266 aa21.78■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 BPGMP07738 259 aa21.78■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 CHMP24386 653 aa21.78■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 CTSSP25774 331 aa21.78■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 DPP4P27487 766 aa21.78■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 ARRB2P32121 409 aa21.78■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 GABRA3P34903 492 aa21.78■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 GPC1P35052 558 aa21.78■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 MAP3K8P41279 467 aa21.78■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 ETV4P43268 484 aa21.78■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 ASMTP46597 345 aa21.78■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 LHX2P50458 406 aa21.78■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 ASCL1P50553 236 aa21.78■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 MANFP55145 182 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa21.78■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 FADS6Q8N9I5 356 aa21.78■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 OR4K17Q8NGC6 315 aa21.78■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 CEP70Q8NHQ1 597 aa21.78■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 PPP3R2Q96LZ3 170 aa21.78■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 UCN2Q96RP3 112 aa21.78■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 SH3GL2Q99962 352 aa21.78■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 DSN1Q9H410 356 aa21.78■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 C3orf14Q9HBI5 128 aa21.78■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 SDHAF3Q9NRP4 125 aa21.78■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa21.78■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa21.78■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 DKKL1Q9UK85 242 aa21.78■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 ABCG2Q9UNQ0 655 aa21.78■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 SRYQ05066 204 aa21.77■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 MYBPHQ13203 477 aa21.77■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 XKR7Q5GH72 579 aa21.77■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 C9orf106Q8NAJ2 232 aa21.77■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 NUP43Q8NFH3 380 aa21.77■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 OR2M3Q8NG83 312 aa21.77■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 SFXN2Q96NB2 322 aa21.77■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 PARD6BQ9BYG5 372 aa21.77■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 RTN4RQ9BZR6 473 aa21.77■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 GIMAP2Q9UG22 337 aa21.77■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 OTOGQ6ZRI0 2925 aa21.77■■□□□ 1.08
PPP1CB-208ENST00000455580 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa21.76■■□□□ 1.07
PPP1CB-208ENST00000455580 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa21.76■■□□□ 1.07
PPP1CB-208ENST00000455580 GXYLT2A0PJZ3 443 aa21.76■■□□□ 1.07
PPP1CB-208ENST00000455580 H0Y3Z8 333 aa21.76■■□□□ 1.07
PPP1CB-208ENST00000455580 PEX11AO75192 247 aa21.76■■□□□ 1.07
PPP1CB-208ENST00000455580 NKX2-2O95096 273 aa21.76■■□□□ 1.07
PPP1CB-208ENST00000455580 IL18BPO95998 194 aa21.76■■□□□ 1.07
PPP1CB-208ENST00000455580 UQCRC1P31930 480 aa21.76■■□□□ 1.07
PPP1CB-208ENST00000455580 PEX19P40855 299 aa21.76■■□□□ 1.07
PPP1CB-208ENST00000455580 CLK3P49761 638 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
PPP1CB-208ENST00000455580 PRKAG1P54619 331 aa21.76■■□□□ 1.07
PPP1CB-208ENST00000455580 B3GALT5-AS1P59052 145 aa21.76■■□□□ 1.07
PPP1CB-208ENST00000455580 LRIG3Q6UXM1 1119 aa21.76■■□□□ 1.07
PPP1CB-208ENST00000455580 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
PPP1CB-208ENST00000455580 AGR3Q8TD06 166 aa21.76■■□□□ 1.07
PPP1CB-208ENST00000455580 DUSP19Q8WTR2 217 aa21.76■■□□□ 1.07
PPP1CB-208ENST00000455580 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
PPP1CB-208ENST00000455580 GIMAP5Q96F15 307 aa21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms