RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445961.5

RPS9-208, Transcript of ribosomal protein S9, human

TSL 5

Gene RPS9, Length 944 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS9-208	ENST00000445961	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RPS9-208	ENST00000445961	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RPS9-208	ENST00000445961	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RPS9-208	ENST00000445961	DSN1	Q9H410	356 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RPS9-208	ENST00000445961	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RPS9-208	ENST00000445961	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RPS9-208	ENST00000445961	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
RPS9-208	ENST00000445961	SPG11	Q96JI7	2443 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RPS9-208	ENST00000445961	AKAP9	Q99996	3911 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RPS9-208	ENST00000445961	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961		A0A087WV62	115 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	CLCA1	A8K7I4	914 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961		H3BQF6	201 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	SLC28A1	O00337	649 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	AKAP10	O43572	662 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	ZIC3	O60481	467 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	DPP4	P27487	766 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	LHX2	P50458	406 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	ART1	P52961	327 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	IST1	P53990	364 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	NAA20	P61599	178 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	HSPB3	Q12988	150 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	STX5	Q13190	355 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	ZNF385B	Q569K4	471 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961		Q6ZSR9	355 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	LINC01560	Q8TB33	94 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	ELP4	Q96EB1	424 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	LRRC46	Q96FV0	321 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	MED11	Q9P086	117 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	CBLC	Q9ULV8	474 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	PLOD2	O00469	737 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	AZIN1	O14977	448 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	RGS14	O43566	566 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	GMFG	O60234	142 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	FADS1	O60427	444 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	LINC00032	P0C843	101 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	ALDH3A1	P30838	453 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	EVI2B	P34910	448 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	OPRM1	P35372	400 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	CLDN18	P56856	261 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	LUZP2	Q86TE4	346 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	MARCH3	Q86UD3	253 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	OR2L13	Q8N349	312 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	OR2M3	Q8NG83	312 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	PIK3R3	Q92569	461 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	PGM2	Q96G03	612 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	TSSK3	Q96PN8	268 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	EQTN	Q9NQ60	294 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	C1orf109	Q9NX04	203 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961		A6NNC1	897 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	TMEM233	B4DJY2	109 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	TRIM13	O60858	407 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	SPAG7	O75391	227 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	RCBTB2	O95199	551 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	PSMG1	O95456	288 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	CHRNG	P07510	517 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	ZNF708	P17019	499 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	HK1	P19367	917 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	PRPH2	P23942	346 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	GABRA3	P34903	492 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	GPC1	P35052	558 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	PRKAG1	P54619	331 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	DECR1	Q16698	335 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	AAGAB	Q6PD74	315 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	GALNT10	Q86SR1	603 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	CDC20B	Q86Y33	519 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	FADS6	Q8N9I5	356 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RPS9-208	ENST00000445961	FAM222B	Q8WU58	562 aa		12.81	□□□□□ -0.36

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