RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 CASKO14936 926 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 SEC14L2O76054 403 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 HSD17B2P37059 387 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 RPA4Q13156 261 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM214AQ32MH5 1076 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 TCTN3Q6NUS6 607 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 BORAQ6PGQ7 559 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 MS4A6EQ96DS6 147 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 MRGPRX1Q96LB2 322 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 IER2Q9BTL4 223 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 HDHD5Q9BXW7 423 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 DPH1Q9BZG8 443 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 RACGAP1Q9H0H5 632 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 RTTNQ86VV8 2226 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 CHRM4P08173 479 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 JUNDP17535 347 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 GRPRP30550 384 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 PDX1P52945 283 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC35A2P78381 396 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 ODF4Q2M2E3 257 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 DEFB133Q30KQ1 61 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 ABHD17CQ6PCB6 329 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM92Q6UXU6 159 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 OR4D11Q8NGI4 311 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 PIGXQ8TBF5 258 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 ZFPM2Q8WW38 1151 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 EPYCQ99645 322 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM246Q9BRR3 403 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 ACTR10Q9NZ32 417 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 HCN2Q9UL51 889 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 GPR179Q6PRD1 2367 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 ARID1AO14497 2285 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 PRAMEF25A6NGN4 478 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 PIP5K1CO60331 668 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 CSF2P04141 144 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 FHP07954 510 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 ITPKBP27987 946 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 CRYBA2P53672 197 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM64Q6YI46 380 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 NRROSQ86YC3 692 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 OR8H3Q8N146 312 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 TSTD1Q8NFU3 115 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 RSC1A1Q92681 617 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 TM9SF2Q99805 663 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM45AQ9NWC5 275 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 POU2F3Q9UKI9 436 aa12.74□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 SH3PXD2BA1X283 911 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 CDC14CA4D256 554 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC16A6O15403 523 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 CELP19835 753 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 REEP5Q00765 189 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 DDI2Q5TDH0 399 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 CDK20Q8IZL9 346 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 CSNK1A1LQ8N752 337 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 AVL9Q8NBF6 648 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 GPR32P1Q8NGA4 272 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 KLHL6Q8WZ60 621 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 SSR3Q9UNL2 185 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 H0YGG7 62 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC22A1O15245 554 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 HHEXQ03014 270 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 LAIR2Q6ISS4 152 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 PRR22Q8IZ63 422 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 KBTBD8Q8NFY9 601 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 PELI2Q9HAT8 420 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 DZANK1Q9NVP4 752 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 C4orf51C9J302 202 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 K7EQS6 105 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 SMIM11AP58511 58 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF404Q494X3 552 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 OTPQ5XKR4 325 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM131AQ6UXB0 335 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF765Q7L2R6 523 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 PRSS48Q7RTY5 328 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 NKAIN4Q8IVV8 208 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 DNAJC22Q8N4W6 341 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 OR4F15Q8NGB8 312 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC7A7Q9UM01 511 aa12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 URADA6NGE7 173 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 EMC8O43402 210 aa12.72□□□□□ -0.37
RABGEF1-210ENST00000437078 TNFP01375 233 aa12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 114.7 ms