RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 THSD1Q9NS62 852 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 A0A0U1RQS6 177 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 SSX4O60224 188 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 DCNP07585 359 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 ECHDC3Q96DC8 303 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 REV1Q9UBZ9 1251 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 MYH3P11055 1940 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF840PA6NDX5 716 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 PIP5K1CO60331 668 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 KNG1P01042 644 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 MPC1LP0DKB6 136 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 GHRHRQ02643 423 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 LEG1Q6P5S2 330 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 RASGRP3Q8IV61 690 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 CPOQ8IVL8 374 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 OR52N2Q8NGI0 321 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 GLYATL1Q969I3 302 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 NT5C3BQ969T7 300 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 SLC25A18Q9H1K4 315 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 MT-ND4P03905 459 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 POU3F4P49335 361 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 KEAP1Q14145 624 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 MBTPS1Q14703 1052 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 PLAG1Q6DJT9 500 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 TTC9BQ8N6N2 239 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 ALG8Q9BVK2 526 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 LIPT1Q9Y234 373 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 CTDSP2O14595 271 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 PPP1R3DO95685 299 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 GPX3P22352 226 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 RIDAP52758 137 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 RAB4BP61018 213 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 GALEQ14376 348 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 GPR19Q15760 415 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 METTL11BQ5VVY1 283 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 TRIM46Q7Z4K8 759 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 OR5H6Q8NGV6 325 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 K7ERQ8 282 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 CD68P34810 354 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 GLYATL2Q8WU03 294 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 PDLIM7Q9NR12 457 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 C9J4A7 227 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 ACPPP15309 386 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 TNFSF8P32971 234 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 KCNC1P48547 511 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 WNT7BP56706 349 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 C16orf58Q96GQ5 468 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 SULT4A1Q9BR01 284 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 DPH1Q9BZG8 443 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 VRTNQ9H8Y1 702 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 TUBG2Q9NRH3 451 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 ACSL5Q9ULC5 683 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 SLC16A5O15375 505 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 TFAP2AP05549 437 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 PFKLP17858 780 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 NFATC4Q14934 902 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 CATSPEREQ5SY80 951 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 C16orf78Q8WTQ4 265 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 LRFN1Q9P244 771 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 HCSTQ9UBK5 93 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 MYH6P13533 1939 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 PPP6CO00743 305 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 IFNA1P01562 189 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 GIFP27352 417 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 HSD11B2P80365 405 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 RAB33AQ14088 237 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 PPA1Q15181 289 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 FAM205BPQ63HN1 556 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 C3P1Q6ZMU1 363 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 PXKQ7Z7A4 578 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 CHFRQ96EP1 664 aa13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms