RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427193.1

C9orf3-205, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 704 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-205ENST00000427193 TAF8Q7Z7C8 310 aa5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 GKN2Q86XP6 184 aa5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 NUDCD3Q8IVD9 361 aa5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 FBXO39Q8N4B4 442 aa5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 ARL10Q8N8L6 244 aa5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 ANKRD42Q8N9B4 389 aa5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 AVL9Q8NBF6 648 aa5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 OR52B6Q8NGF0 335 aa5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 MAGEC3Q8TD91 643 aa5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 LMX1AQ8TE12 382 aa5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 AGAP11Q8TF27 550 aa5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 KCNE4Q8WWG9 221 aa5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 ATL1Q8WXF7 558 aa5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 ESAMQ96AP7 390 aa5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 C12orf66Q96MD2 445 aa5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF382Q96SR6 550 aa5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 KLHL31Q9H511 634 aa5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 KCNK13Q9HB14 408 aa5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 ARL15Q9NXU5 204 aa5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 PSD3Q9NYI0 1048 aa5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 CCL27Q9Y4X3 112 aa5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 HIVEP1P15822 2718 aa5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 SEC16AO15027 2179 aa5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 RP1P56715 2156 aa5.12□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 SVILO95425 2214 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 PDZK1P1A8MUH7 402 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 H0YIV9 168 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 H3BMH7 237 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 STMND1H3BQB6 276 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 KLK10O43240 276 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 B4GAT1O43505 415 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 SDC3O75056 442 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 SMIM24O75264 130 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 C9P02748 559 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 CKMT1AP12532 417 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 SLC2A4P14672 509 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 SHMT2P34897 504 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 HALP42357 657 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 HSPA7P48741 367 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 PNLIPRP1P54315 467 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 CDH13P55290 713 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 MAZP56270 477 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 TBPL1P62380 186 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 NAE1Q13564 534 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 RCN2Q14257 317 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 CHI3L2Q15782 390 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 DEFB133Q30KQ1 61 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 LINC00303Q3SY05 128 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 XKR7Q5GH72 579 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 LCTLQ6UWM7 567 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 PIGWQ7Z7B1 504 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 TICAM1Q8IUC6 712 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 SMPDL3AQ92484 453 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 NEIL2Q969S2 332 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 TSNARE1Q96NA8 513 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 FOPNLQ96NB1 174 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF285Q96NJ3 590 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 IL17FQ96PD4 163 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 OR2A14Q96R47 310 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 SELENOSQ9BQE4 189 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 CAPS2Q9BXY5 557 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 TUBB1Q9H4B7 451 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 THAP1Q9NVV9 213 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 SPHK1Q9NYA1 384 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 CD274Q9NZQ7 290 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 MOSPD1Q9UJG1 213 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 PILRAQ9UKJ1 303 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 SLC22A14Q9Y267 594 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 TMEM131Q92545 1883 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 DOCK7Q96N67 2140 aa5.11□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa5.1□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 A0A1W2PQM1 296 aa5.1□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 OR2A25A4D2G3 310 aa5.1□□□□□ -1.59
C9orf3-205ENST00000427193 OR5K3A6NET4 321 aa5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms