RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423693.5

HDLBP-210, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-210ENST00000423693 SLC35G5Q96KT7 338 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 INPP5KQ9BT40 448 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 TTTY12Q9BZ98 90 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 HOXD1Q9GZZ0 328 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 METTL7AQ9H8H3 244 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 PROK2Q9HC23 129 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 ZFP64Q9NPA5 681 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 EXD2Q9NVH0 621 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 QPCTLQ9NXS2 382 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 B4GALT7Q9UBV7 327 aa11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 A0A096LPI6 279 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 GXYLT2A0PJZ3 443 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 PRAMEF25A6NGN4 478 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 NR5A2O00482 541 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 CCDC22O60826 627 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 ICOSLGO75144 302 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 CBX6O95503 412 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 CYP4B1P13584 511 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 PTPN6P29350 595 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 DNASE1L1P49184 302 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 TDGF1P3P51864 188 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 SEC24CP53992 1094 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 PMP22Q01453 160 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 PLGLB1Q02325 96 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 C6orf10Q5SRN2 563 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 LRIF1Q5T3J3 769 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 ATAD3BQ5T9A4 648 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 PRAMEF20Q5VT98 475 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 AP1ARQ63HQ0 302 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 SPATA21Q7Z572 469 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 SIAH3Q8IW03 269 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 ZFP90Q8TF47 636 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 CDS1Q92903 461 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF597Q96LX8 424 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 OR7D2Q96RA2 312 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 NODALQ96S42 347 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 YIPF4Q9BSR8 244 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 SAR1AQ9NR31 198 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 SDHAF3Q9NRP4 125 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 KLRF1Q9NZS2 232 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 NDUFAF1Q9Y375 327 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 GMEB1Q9Y692 573 aa11.86□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 A0A0G2JMM0 328 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 A0A1W2PPB8 328 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 A0A1W2PRS3 328 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 PINLYPA6NC86 204 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 KIR3DP1A8MWS1 328 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 G3V3Y1 287 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 J3QKU1 62 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 TFECO14948 347 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 ANGPT2O15123 496 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 FADS1O60427 444 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 GSNP06396 782 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 ATP6V1C1P21283 382 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 PPIBP23284 216 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 MST1P26927 711 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 EVI2BP34910 448 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 PTGDSP41222 190 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 CDKN2CP42773 168 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 MASP1P48740 699 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 KHKP50053 298 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 GYS2P54840 703 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 PPIAP62937 165 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 MAPRE2Q15555 327 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP11.85□□□□□ -0.512e-7■□□□□ 10.6
HDLBP-210ENST00000423693 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 COQ5Q5HYK3 327 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 RNFT1Q5M7Z0 435 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 DCST2Q5T1A1 773 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 TIGD3Q6B0B8 471 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 SLC2A7Q6PXP3 512 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 RNF130Q86XS8 419 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 CLEC4FQ8N1N0 589 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 FAM109AQ8N4B1 249 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 DPP10Q8N608 796 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 FBXO30Q8TB52 745 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 OIT3Q8WWZ8 545 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 GPR137Q96N19 417 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 OSBPL11Q9BXB4 747 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 OR51I1Q9H343 314 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 RAD21L1Q9H4I0 556 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 TPT1P8Q9HAU6 139 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 POLE3Q9NRF9 147 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 UBQLN4Q9NRR5 601 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 SEC14L3Q9UDX4 400 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 LIPT1Q9Y234 373 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 KALRNO60229 2985 aa11.85□□□□□ -0.51
HDLBP-210ENST00000423693 NPIPA5E9PKD4 350 aa11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms