RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 ASPGQ86U10 573 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 FAM20CQ8IXL6 584 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 ANKK1Q8NFD2 765 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 OR9A2Q8NGT5 310 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 ADAMTS15Q8TE58 950 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 GANCQ8TET4 914 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 LCN9Q8WX39 176 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 SMIM10Q96HG1 83 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 NELL2Q99435 816 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 MACROD1Q9BQ69 325 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 JAM3Q9BX67 310 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 TTC28Q96AY4 2481 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 K7EQS6 105 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 KLF4O43474 513 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 TNFSF14O43557 240 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 NTSR1P30989 418 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 BTN3A2P78410 334 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 TNFRSF17Q02223 184 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 ACSM1Q08AH1 577 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 LIPKQ5VXJ0 399 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 MFSD12Q6NUT3 480 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 VN1R4Q7Z5H5 301 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 POGLUT1Q8NBL1 392 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 OR52P1PQ8NH57 321 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 ASB15Q8WXK1 588 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 RNFT2Q96EX2 444 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 SERINC2Q96SA4 455 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 SEMA4GQ9NTN9 838 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 NLGN3Q9NZ94 848 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 PTGFRNQ9P2B2 879 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 MOSPD1Q9UJG1 213 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 ZNF232Q9UNY5 417 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 CMAHPQ9Y471 501 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 CHST2Q9Y4C5 530 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 V9GYH0 126 aa22.24■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 URADA6NGE7 173 aa22.23■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 TSPAN19P0C672 248 aa22.23■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 C8orf89P0DMQ9 161 aa22.23■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 SLC9A3P48764 834 aa22.23■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa22.23■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 OLIG3Q7RTU3 272 aa22.23■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 SLC35A4Q96G79 324 aa22.23■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 KCTD7Q96MP8 289 aa22.23■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 EGLN3Q9H6Z9 239 aa22.23■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 FGF22Q9HCT0 170 aa22.23■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 SLC30A4O14863 429 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 THBS1P07996 1170 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 SLC35G6P0C7Q6 338 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 ALPPL2P10696 532 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 GABRA5P31644 462 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 EIPR1Q53HC9 387 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 SDE2Q6IQ49 451 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 PAQR6Q6TCH4 344 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 PRR23CQ6ZRP0 262 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 VRK2Q86Y07 508 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 OR2L13Q8N349 312 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 OR8D4Q8NGM9 314 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 PMM1Q92871 262 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 SNTG1Q9NSN8 517 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 CA14Q9ULX7 337 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 SEC14L5O43304 696 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 DYRK3O43781 588 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 HMGN1P05114 100 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
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PMS1-205ENST00000409985 ZNF485Q8NCK3 441 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 IL17RDQ8NFM7 739 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 AP3S1Q92572 193 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 UFD1Q92890 307 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 OR2A14Q96R47 310 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 KCMF1Q9P0J7 381 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa22.22■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 SPNP16150 400 aa22.21■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 TPTEP56180 551 aa22.21■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 TMEM196Q5HYL7 178 aa22.21■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 FRRS1Q6ZNA5 592 aa22.21■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 QSOX2Q6ZRP7 698 aa22.21■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 USP53Q70EK8 1073 aa22.21■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 PEX5LQ8IYB4 626 aa22.21■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 OR4K14Q8NGD5 310 aa22.21■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 EVA1AQ9H8M9 152 aa22.21■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 SYNPO2LQ9H987 977 aa22.21■■□□□ 1.15
PMS1-205ENST00000409985 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
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