RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403084.1

CLDN5-201, Transcript of claudin 5, humanhuman

BASIC

Gene CLDN5, Length 2,357 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5-201ENST00000403084 SPATA2Q9UM82 520 aa20.52■□□□□ 0.88
CLDN5-201ENST00000403084 COPS3Q9UNS2 423 aa20.52■□□□□ 0.88
CLDN5-201ENST00000403084 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CLDN5-201ENST00000403084 DOCK6Q96HP0 2047 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 A0A0G2JK05 382 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 SAP18O00422 153 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 COCHO43405 550 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 PEX14O75381 377 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 ALDOBP05062 364 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 IL3P08700 152 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 SHC1P29353 583 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 CSKP41240 450 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 MAPK8P45983 427 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 MAPK9P45984 424 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 OR1G1P47890 313 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 CSNK1DP48730 415 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 DGCR2P98153 550 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 ETFDHQ16134 617 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 IER5LQ5T953 404 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 STPG2Q8N412 459 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 ASIC4Q96FT7 647 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 FAIM2Q9BWQ8 316 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 C20orf85Q9H1P6 137 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 OR6C2Q9NZP2 312 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 ANKDD1BA6NHY2 528 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 LGALS8O00214 317 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 ANKRD34CP0C6C1 535 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 IMPA1P29218 277 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 CALCRP30988 508 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 DYRK1AQ13627 763 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 UAP1L1Q3KQV9 507 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 CCSMST1Q4G0I0 132 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 TMPRSS11BQ86T26 416 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 SLITRK4Q8IW52 837 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 ASZ1Q8WWH4 475 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 WBP2Q969T9 261 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 SCPEP1Q9HB40 452 aa20.51■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 L7N2F9 121 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 HMGN4O00479 90 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF197O14709 1029 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 PRAF2O60831 178 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 TBL1XO60907 577 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 MT-ND4P03905 459 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 RPS7P62081 194 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 PTSQ03393 145 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 SERINC5Q86VE9 423 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 TPRA1Q86W33 373 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 MMP21Q8N119 569 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 DCAF4L2Q8NA75 395 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 ELMOD3Q96FG2 381 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 OR51B5Q9H339 312 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 IFT22Q9H7X7 185 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 Q9Y3F1 56 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 AIPO00170 330 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 PTP4A3O75365 173 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 TGFB1P01137 390 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 TFP02787 698 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 KLK1P06870 262 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 OR10A3P58181 314 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 PITPNAQ00169 270 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 ZSWIM7Q19AV6 140 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 CLRN3Q8NCR9 226 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 NPAS1Q99742 590 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 SLC6A17Q9H1V8 727 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 MIEF1Q9NQG6 463 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 KCNJ13O60928 360 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 SLC16A8O95907 504 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 WNT1P04628 370 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 IRF1P10914 325 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 GPR17Q13304 367 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 OR51Q1Q8NH59 317 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 SCARB1Q8WTV0 552 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 ECHDC3Q96DC8 303 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 PRRC1Q96M27 445 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 UQCC2Q9BRT2 126 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 BEX1Q9HBH7 125 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 PIPOXQ9P0Z9 390 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 ABCD4O14678 606 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 FCER2P06734 321 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 SDHBP21912 280 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 Q6ZTK2 550 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 APCDD1Q8J025 514 aa20.49■□□□□ 0.87
CLDN5-201ENST00000403084 KCT2Q8NC54 265 aa20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms