RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000383698.3

VGLL3-201, Transcript of vestigial like family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGLL3, Length 2,475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3-201ENST00000383698 MINDY4Q4G0A6 757 aa20.11■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 ZNF425Q6IV72 752 aa20.11■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 TMEM53Q6P2H8 277 aa20.11■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 AMIGO1Q86WK6 493 aa20.11■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 SHISA5Q8N114 240 aa20.11■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 OTULINQ96BN8 352 aa20.11■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 KCTD7Q96MP8 289 aa20.11■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 ACTRT3Q9BYD9 372 aa20.11■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 SYT5O00445 386 aa20.1■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 SLC2A10O95528 541 aa20.1■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 LALBAP00709 142 aa20.1■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 IL1AP01583 271 aa20.1■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 PPP2CBP62714 309 aa20.1■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 PPP2CAP67775 309 aa20.1■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 FABP5Q01469 135 aa20.1■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 BNC1Q01954 994 aa20.1■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 UFD1Q92890 307 aa20.1■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 MCHR1Q99705 422 aa20.1■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 TRPV4Q9HBA0 871 aa20.1■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 SCN2AQ99250 2005 aa20.1■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa20.1■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 TFECO14948 347 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 TEAD1P28347 426 aa20.1■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 HOXD12P35452 270 aa20.1■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 ID2Q02363 134 aa20.1■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 PLK5Q496M5 336 aa20.1■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 CCNJQ5T5M9 372 aa20.1■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa20.1■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 CCL4L1Q8NHW4 92 aa20.1■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 DIRAS2Q96HU8 199 aa20.1■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 WDFY2Q96P53 400 aa20.1■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 TMEM74BQ9NUR3 256 aa20.1■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 OBP2AQ9NY56 170 aa20.1■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 TMEM129A0AVI4 362 aa20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 POM121BA6NF01 834 aa20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 A8MV72 311 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 DUSP6Q16828 381 aa20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 B3GLCTQ6Y288 498 aa20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 GDF7Q7Z4P5 450 aa20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 SCAIQ8N9R8 606 aa20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 CAPSLQ8WWF8 208 aa20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 KATNB1Q9BVA0 655 aa20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 RMI1Q9H9A7 625 aa20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 KLHL28Q9NXS3 571 aa20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 SNX7Q9UNH6 387 aa20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 SNTNA6NMZ2 147 aa20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 H0Y8X5 98 aa20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 SLC30A4O14863 429 aa20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 ADPRHP54922 357 aa20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 COPZ1P61923 177 aa20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 ENPP2Q13822 863 aa20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 INSL4Q14641 139 aa20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 FRRS1Q6ZNA5 592 aa20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 MRGPREQ86SM8 312 aa20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 GALNT12Q8IXK2 581 aa20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 C7orf61Q8IZ16 206 aa20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 UBE2J2Q8N2K1 259 aa20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 SLC41A3Q96GZ6 507 aa20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 TMED9Q9BVK6 235 aa20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 MMP28Q9H239 520 aa20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 LIPT1Q9Y234 373 aa20.09■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 PRSS38A1L453 326 aa20.08■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 FABP12A6NFH5 140 aa20.08■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 SLC9A3P48764 834 aa20.08■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 ERVK-21P61565 698 aa20.08■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 FAM214AQ32MH5 1076 aa20.08■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 DEFB134Q4QY38 66 aa20.08■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 MFSD12Q6NUT3 480 aa20.08■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 QSOX2Q6ZRP7 698 aa20.08■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 PAQR7Q86WK9 346 aa20.08■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 FGF14Q92915 247 aa20.08■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 ARSGQ96EG1 525 aa20.08■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 C10orf90Q96M02 699 aa20.08■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 TBC1D17Q9HA65 648 aa20.08■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 SLC7A7Q9UM01 511 aa20.08■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 CLCA2Q9UQC9 943 aa20.08■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
VGLL3-201ENST00000383698 STK25O00506 426 aa20.08■□□□□ 0.8
VGLL3-201ENST00000383698 SURF4O15260 269 aa20.08■□□□□ 0.8
VGLL3-201ENST00000383698 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
VGLL3-201ENST00000383698 CPN2P22792 545 aa20.08■□□□□ 0.8
VGLL3-201ENST00000383698 SLC1A3P43003 542 aa20.08■□□□□ 0.8
VGLL3-201ENST00000383698 GPR50Q13585 617 aa20.08■□□□□ 0.8
VGLL3-201ENST00000383698 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
VGLL3-201ENST00000383698 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
VGLL3-201ENST00000383698 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 133.6 ms