RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 C12orf71A8MTZ7 269 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 M0R129 80 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 RP2O75695 350 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 TFPTP0C1Z6 253 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 AMY2BP19961 511 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 SLC6A8P48029 635 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 TDGQ13569 410 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 SHFQ7M4L6 423 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF709Q8N972 641 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF480Q8WV37 535 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 DDIT4LQ96D03 193 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 NUMA1Q14980 2115 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 WNT4P56705 351 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 BTBD16Q32M84 506 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 BEND4Q6ZU67 534 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 OR52E1Q8NGJ3 308 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 STOML3Q8TAV4 291 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 ASB15Q8WXK1 588 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 LMAN1LQ9HAT1 526 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 A6NCN8 305 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 PCP4L1A6NKN8 68 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 M0R036 132 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 OR2T1O43869 369 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 SFTPBP07988 381 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 THBS2P35442 1172 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 POU3F4P49335 361 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 GORASP2Q9H8Y8 452 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 CD207Q9UJ71 328 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 A6NLC8 198 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 PPP6CO00743 305 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 GNMTQ14749 295 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 ARL6IP1Q15041 203 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 NADSYN1Q6IA69 706 aa19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 MAS1P04201 325 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 LSAMPQ13449 338 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF619Q8N2I2 560 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 DPH1Q9BZG8 443 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 FOLH1BQ9HBA9 442 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 KCNN3Q9UGI6 736 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 HIF3AQ9Y2N7 669 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 GABRR3A8MPY1 467 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 A8MV72 311 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 HLA-FP30511 346 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 STT3AP46977 705 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 PRLHRP49683 370 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 RAB11BQ15907 218 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 FNDC8Q8TC99 324 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 TCEAL4Q96EI5 215 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 CRB3Q9BUF7 120 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 CWH43Q9H720 699 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 CNIH4Q9P003 139 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 COPZ2Q9P299 210 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 F5H0A9 414 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 TAZQ16635 292 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 GALNT11Q8NCW6 608 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 TIMM29Q9BSF4 260 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 ERVK13-1Q9NX77 482 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 NENFQ9UMX5 172 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 RDH16O75452 317 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 PPP1R3DO95685 299 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 ACTBP60709 375 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 ACTG1P63261 375 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF611Q8N823 705 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 LHPPQ9H008 270 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 SLC7A7Q9UM01 511 aa19.15■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 GJE1A6NN92 205 aa19.14■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 ADAM12O43184 909 aa19.14■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 DIRAS3O95661 229 aa19.14■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 PRLP01236 227 aa19.14■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 ALKAL1Q6UXT8 129 aa19.14■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 UEVLDQ8IX04 471 aa19.14■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM239Q8WW34 195 aa19.14■□□□□ 0.66
CCSAP-203ENST00000366687 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 I3L1I5 382 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 CLDN2P57739 230 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 TRNP1Q6NT89 227 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM205Q6UW68 189 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 C3orf30Q96M34 536 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 SLC6A16Q9GZN6 736 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 SRPK3Q9UPE1 567 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 PRSS21Q9Y6M0 314 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa19.14■□□□□ 0.65
CCSAP-203ENST00000366687 A8MVJ9 347 aa19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms