RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 CPNE7Q9UBL6 633 aa19.56■□□□□ 0.72
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NISCH-201ENST00000345716 F3P13726 295 aa19.55■□□□□ 0.72
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NISCH-201ENST00000345716 LINC01599Q8WXQ3 324 aa19.55■□□□□ 0.72
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NISCH-201ENST00000345716 FRMPD2BQ6IN97 320 aa19.54■□□□□ 0.72
NISCH-201ENST00000345716 WASH2PQ6VEQ5 465 aa19.54■□□□□ 0.72
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NISCH-201ENST00000345716 FTSJ1Q9UET6 329 aa19.54■□□□□ 0.72
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NISCH-201ENST00000345716 FXYD6Q9H0Q3 95 aa19.54■□□□□ 0.72
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NISCH-201ENST00000345716 FMO6PO60774 539 aa19.53■□□□□ 0.72
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NISCH-201ENST00000345716 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa19.53■□□□□ 0.72
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NISCH-201ENST00000345716 RLN3Q8WXF3 142 aa19.53■□□□□ 0.72
NISCH-201ENST00000345716 ADAM29Q9UKF5 820 aa19.53■□□□□ 0.72
NISCH-201ENST00000345716 OPRL1P41146 370 aa19.53■□□□□ 0.72
NISCH-201ENST00000345716 TUBB3Q13509 450 aa19.53■□□□□ 0.72
NISCH-201ENST00000345716 NXPE2Q96DL1 559 aa19.53■□□□□ 0.72
NISCH-201ENST00000345716 VSTM2BA6NLU5 285 aa19.53■□□□□ 0.72
NISCH-201ENST00000345716 CCNOP22674 350 aa19.53■□□□□ 0.72
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