RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344376.9

ATG4B-201, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 1,566 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-201ENST00000344376 RFX3P48380 749 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 PRR5P85299 388 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 GAB1Q13480 694 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 CPTPQ5TA50 214 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 HHATQ5VTY9 493 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 VASNQ6EMK4 673 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 GDF7Q7Z4P5 450 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 NATD1Q8N6N6 113 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 CDRT4Q8N9R6 151 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 WDSUB1Q8N9V3 476 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 NUP43Q8NFH3 380 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 OR4K17Q8NGC6 315 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 GPR151Q8TDV0 419 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 UGT2B28Q9BY64 529 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 OR2B2Q9GZK3 357 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 PRDM14Q9GZV8 571 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 SDHAF3Q9NRP4 125 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 DKKL1Q9UK85 242 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 RAP2CQ9Y3L5 183 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 PCNX1Q96RV3 2341 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 C19orf84I3L1E1 186 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 ITM2AO43736 263 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 SCO2O43819 266 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 BMP7P18075 431 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 PRPS1L1P21108 318 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 SRD5A2P31213 254 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 GABRA3P34903 492 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 SLC1A6P48664 564 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 DMTNQ08495 405 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 STX3Q13277 289 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 PTGR1Q14914 329 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 MLC1Q15049 377 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 IFNEQ86WN2 208 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF781Q8N8C0 355 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 OR7A2PQ8NGA2 310 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 RNF138Q8WVD3 245 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 SLC9A6Q92581 669 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 ZBTB9Q96C00 473 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 SPOCK3Q9BQ16 436 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 TAS2R10Q9NYW0 307 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 NTMQ9P121 344 aa14.64□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 NINQ8N4C6 2090 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 CELSR2Q9HCU4 2923 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 A0A0G2JNJ9 132 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 A0A1W2PRB8 838 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 HSPB2A8KAH6 182 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 BGNP21810 368 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 RPL14P50914 215 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 EMX2Q04743 252 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 RCAN2Q14206 197 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 HSPB2Q16082 182 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 SMU1Q2TAY7 513 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 AAGABQ6PD74 315 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 ENPP6Q6UWR7 440 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 HDXQ7Z353 690 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 LACC1Q8IV20 430 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 ANKRD42Q8N9B4 389 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 Q9UFV3 132 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa14.63□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 NKX2-6A6NCS4 301 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 NKX2-2O95096 273 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 LAMP1P11279 417 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 KIR3DL1P43629 444 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 PRIM2P49643 509 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 CES4AQ5XG92 561 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 OR5M10Q6IEU7 315 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 OR5P2Q8WZ92 322 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 SFXN2Q96NB2 322 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 UCK2Q9BZX2 261 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 HHATLQ9HCP6 504 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 ASIC5Q9NY37 505 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 FBXL2Q9UKC9 423 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 SNX8Q9Y5X2 465 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 FADS1O60427 444 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 EPPINO95925 133 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 ALOX5P09917 674 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 G6PDP11413 515 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 DPP4P27487 766 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 ADH7P40394 386 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 GAS1P54826 345 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 STX5Q13190 355 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 MPP2Q14168 576 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.1 ms