RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 ACTRT3Q9BYD9 372 aa20.13■□□□□ 0.81
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PTDSS1-201ENST00000337004 PROM1O43490 865 aa20.12■□□□□ 0.81
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PTDSS1-201ENST00000337004 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.812e-7■■■■□ 23.8
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PTDSS1-201ENST00000337004 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PTDSS1-201ENST00000337004 ASB16Q96NS5 453 aa20.1■□□□□ 0.81
PTDSS1-201ENST00000337004 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PTDSS1-201ENST00000337004 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PTDSS1-201ENST00000337004 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PTDSS1-201ENST00000337004 ADAM30Q9UKF2 790 aa20.1■□□□□ 0.81
PTDSS1-201ENST00000337004 A6NL46 340 aa20.09■□□□□ 0.81
PTDSS1-201ENST00000337004 CMPK1P30085 196 aa20.09■□□□□ 0.81
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