RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa24.57■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 ANGPT2O15123 496 aa24.56■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 ASNA1O43681 348 aa24.56■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 PTPN6P29350 595 aa24.56■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 KCNJ2P63252 427 aa24.56■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP24.56■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 PAGE3Q5JUK9 113 aa24.56■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 LRIF1Q5T3J3 769 aa24.56■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 PRAMEF20Q5VT98 475 aa24.56■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 SLC30A6Q6NXT4 461 aa24.56■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 FAR1Q8WVX9 515 aa24.56■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 NODALQ96S42 347 aa24.56■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 SLC6A13Q9NSD5 602 aa24.56■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 SLC28A2O43868 658 aa24.55■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 AK1P00568 194 aa24.55■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 CYP4B1P13584 511 aa24.55■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 CD1EP15812 388 aa24.55■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 RFX3P48380 749 aa24.55■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 KHKP50053 298 aa24.55■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 RPS26P62854 115 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 ATAD3BQ5T9A4 648 aa24.55■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF605Q86T29 641 aa24.55■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 PACS2Q86VP3 889 aa24.55■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 RNF130Q86XS8 419 aa24.55■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 OR5D16Q8NGK9 328 aa24.55■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 FRMD6Q96NE9 622 aa24.55■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 CCT8L2Q96SF2 557 aa24.55■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 DOHHQ9BU89 302 aa24.55■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 SERHL2Q9H4I8 314 aa24.55■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 TPT1P8Q9HAU6 139 aa24.55■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 PROK2Q9HC23 129 aa24.55■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 ASF1BQ9NVP2 202 aa24.55■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 CAPN7Q9Y6W3 813 aa24.55■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 SHANK1Q9Y566 2161 aa24.54■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 DNASE1L1P49184 302 aa24.54■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 CLK3P49761 638 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 TLE1Q04724 770 aa24.54■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 DESI1Q6ICB0 168 aa24.54■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 FIGNL1Q6PIW4 674 aa24.54■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 DPP10Q8N608 796 aa24.54■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 XAGE5Q8WWM1 108 aa24.54■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 RAD21L1Q9H4I0 556 aa24.54■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 NTNG1Q9Y2I2 539 aa24.54■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa24.54■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 KCNE3Q9Y6H6 103 aa24.54■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 PRAMEF25A6NGN4 478 aa24.53■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 G3V3Y1 287 aa24.53■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 ICOSLGO75144 302 aa24.53■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 IGKV1D-16P01601 117 aa24.53■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 OR12D1P0DN82 309 aa24.53■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 ATP6V1C1P21283 382 aa24.53■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 CASP9P55211 416 aa24.53■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 PMP22Q01453 160 aa24.53■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 DCST2Q5T1A1 773 aa24.53■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 NTNG2Q96CW9 530 aa24.53■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 IL1RL2Q9HB29 575 aa24.53■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 OLAHQ9NV23 265 aa24.53■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 KLRF1Q9NZS2 232 aa24.53■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 ABCG2Q9UNQ0 655 aa24.53■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 FREM3P0C091 2139 aa24.53■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 ZGRF1Q86YA3 2104 aa24.52■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 BBIP1A8MTZ0 92 aa24.52■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 CLIC1O00299 241 aa24.52■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 UTS2O95399 124 aa24.52■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 FAM107AO95990 144 aa24.52■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 PPIBP23284 216 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 PLGLB1Q02325 96 aa24.52■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 STX5Q13190 355 aa24.52■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa24.52■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 C16orf62Q7Z3J2 963 aa24.52■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 SDF2Q99470 211 aa24.52■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 OSBPL11Q9BXB4 747 aa24.52■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 HOXD1Q9GZZ0 328 aa24.52■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 ZFP64Q9NPA5 681 aa24.52■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 SLAMF8Q9P0V8 285 aa24.52■■□□□ 1.52
CRIP1-201ENST00000330233 A0A0G2JMM0 328 aa24.51■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 A0A1W2PPB8 328 aa24.51■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 A0A1W2PRS3 328 aa24.51■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 PINLYPA6NC86 204 aa24.51■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 KIR3DP1A8MWS1 328 aa24.51■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 ACOT7O00154 380 aa24.51■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF24P17028 368 aa24.51■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
CRIP1-201ENST00000330233 FOXO1Q12778 655 aa24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms