RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 OLIG3Q7RTU3 272 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARMC8Q8IUR7 673 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 AMER2Q8N7J2 671 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF441Q8N8Z8 693 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 GOLM1Q8NBJ4 401 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF248Q8NDW4 579 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPPL2AQ8TCT8 520 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 SEC14L3Q9UDX4 400 aa25.36■■□□□ 1.65
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CYBRD1Q53TN4 286 aa25.35■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 FRRS1Q6ZNA5 592 aa25.35■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 KBTBD2Q8IY47 623 aa25.35■■□□□ 1.65
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC34A3Q8N130 599 aa25.35■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF619Q8N2I2 560 aa25.35■■□□□ 1.65
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PMM1Q92871 262 aa25.35■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 OLAHQ9NV23 265 aa25.35■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa25.35■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 V9GYQ6 96 aa25.35■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa25.34■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 WWP2O00308 870 aa25.34■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 SUV39H1O43463 412 aa25.34■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
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CTDNEP1-201ENST00000318988 IL12BP29460 328 aa25.34■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 FLYWCH1Q4VC44 716 aa25.34■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 CBLL1Q75N03 491 aa25.34■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM110BQ8TC76 370 aa25.34■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMBIM1Q969X1 311 aa25.34■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 TPD52L3Q96J77 140 aa25.34■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 UGT2B28Q9BY64 529 aa25.34■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYOTQ9UBF9 498 aa25.34■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANAPC2Q9UJX6 822 aa25.34■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 TCRBV5S2A0A599 114 aa25.33■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 DHRS12A0PJE2 317 aa25.33■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 REM1O75628 298 aa25.33■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 SERPINA7P05543 415 aa25.33■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPIP06744 558 aa25.33■■□□□ 1.65
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP25.33■■□□□ 1.65
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC22A8Q8TCC7 542 aa25.33■■□□□ 1.65
CTDNEP1-201ENST00000318988 THAP4Q8WY91 577 aa25.33■■□□□ 1.65
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FBXO34Q9NWN3 711 aa25.33■■□□□ 1.65
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CTDNEP1-201ENST00000318988 IL33O95760 270 aa25.32■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 TCTN3Q6NUS6 607 aa25.32■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZFP1Q6P2D0 407 aa25.32■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 FKBP9P1Q75LS8 142 aa25.32■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRR22Q8IZ63 422 aa25.32■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC5A8Q8N695 610 aa25.32■■□□□ 1.64
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SAP130Q9H0E3 1048 aa25.32■■□□□ 1.64
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CTDNEP1-201ENST00000318988 HS6ST1O60243 411 aa25.32■■□□□ 1.64
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CTDNEP1-201ENST00000318988 OR52P1PQ8NH57 321 aa25.32■■□□□ 1.64
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CTDNEP1-201ENST00000318988 KLK10O43240 276 aa25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRKAR1AP10644 381 aa25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 ABCD3P28288 659 aa25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHRNB3Q05901 458 aa25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1-201ENST00000318988 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
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