RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 MOAP1Q96BY2 351 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 SGCZQ96LD1 299 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 C5orf34Q96MH7 638 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 COL21A1Q96P44 957 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 CCDC106Q9BWC9 280 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 PIGUQ9H490 435 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 TPT1P8Q9HAU6 139 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM45AQ9NWC5 275 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 ANAPC2Q9UJX6 822 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 NDUFAF1Q9Y375 327 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 CAPN7Q9Y6W3 813 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 COL12A1Q99715 3063 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 SHANK1Q9Y566 2161 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 A0A096LPI6 279 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 OR6C70A6NIJ9 312 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 B8ZZF3 427 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa8.34□□□□□ -1.07
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PDE4D-201ENST00000309641 PEX1O43933 1283 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 IL33O95760 270 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 FAM107AO95990 144 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 NUDT7P0C024 238 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 ZCCHC18P0CG32 403 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 ETFAP13804 333 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 NAGAP17050 411 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 IL12BP29460 328 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 PTGDSP41222 190 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 MEOX1P50221 254 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 FOXO1Q12778 655 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 DECR1Q16698 335 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 HMGN2P46Q86SG4 172 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 OR2M7Q8NG81 312 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 FAM110BQ8TC76 370 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 SPPL2AQ8TCT8 520 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 MIPOL1Q8TD10 442 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 FRMD6Q96NE9 622 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 STACQ99469 402 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 DUSP22Q9NRW4 184 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 GIN1Q9NXP7 522 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-201ENST00000309641 NCKAP5O14513 1909 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 MED12Q93074 2177 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 CLIC1O00299 241 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 ANGPT2O15123 496 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 FCMRO60667 390 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 RFPL3SP0C7P2 107 aa8.33□□□□□ -1.08
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PDE4D-201ENST00000309641 LRRC74AQ0VAA2 488 aa8.33□□□□□ -1.08
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PDE4D-201ENST00000309641 FNDC7Q5VTL7 733 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 OR5M10Q6IEU7 315 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 BHLHB9Q6PI77 547 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 NUP54Q7Z3B4 507 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.33□□□□□ -1.08
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PDE4D-201ENST00000309641 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa8.33□□□□□ -1.08
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PDE4D-201ENST00000309641 FXYD1O00168 92 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 CCDC22O60826 627 aa8.32□□□□□ -1.08
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PDE4D-201ENST00000309641 UTS2O95399 124 aa8.32□□□□□ -1.08
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PDE4D-201ENST00000309641 KRT20P35900 424 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 CRATP43155 626 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 NFYCQ13952 458 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 IGFBP7Q16270 282 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 SYPL1Q16563 259 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 GRAMD1BQ3KR37 738 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 REP15Q6BDI9 236 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 DHDDSQ86SQ9 333 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 FBXW8Q8N3Y1 598 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-201ENST00000309641 DPP10Q8N608 796 aa8.32□□□□□ -1.08
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