RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GK3PQ14409 553 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HMGN2P46Q86SG4 172 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARMC8Q8IUR7 673 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ESX1Q8N693 406 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPPL2AQ8TCT8 520 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ADAMTS15Q8TE58 950 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RDH12Q96NR8 316 aa22.13■■□□□ 1.13
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RUBCNLQ9H714 662 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 VNN3Q9NY84 501 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 P2RX2Q9UBL9 471 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GXYLT2A0PJZ3 443 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PDE9AO76083 593 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IFI6P09912 130 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAP3K8P41279 467 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCNJQ5T5M9 372 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR14A16Q8NHC5 309 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 VSTM2LQ96N03 204 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ITPAQ9BY32 194 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TCFL5Q9UL49 500 aa22.13■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC28A2O43868 658 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PRAMEF2O60811 474 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 COQ9O75208 318 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CHRM4P08173 479 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CAPGP40121 348 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FOLR3P41439 243 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 STAT5AP42229 794 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PPP2R2BQ00005 443 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PSG6Q00889 435 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CAMK2BQ13554 666 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TGIF1Q15583 401 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NPSR1Q6W5P4 371 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HS3ST5Q8IZT8 346 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR4N2Q8NGD1 307 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CYGBQ8WWM9 190 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SMURF2Q9HAU4 748 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 U3KQV3 271 aa22.12■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 STMND1H3BQB6 276 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MASP2O00187 686 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DIRAS1O95057 198 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SNAP29O95721 258 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 THRBP10828 461 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPINK2P20155 84 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GABRA3P34903 492 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DLSTP36957 453 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPR143P51810 404 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ARHGDIAP52565 204 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CDRT4Q8N9R6 151 aa22.11■■□□□ 1.13
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NRBF2Q96F24 287 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FBXO34Q9NWN3 711 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa22.11■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PCSK5Q92824 1860 aa22.1■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SAGE2PA6NJ88 616 aa22.1■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 A8MVJ9 347 aa22.1■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 H0YAE9 185 aa22.1■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BRINP1O60477 761 aa22.1■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NR2F1P10589 423 aa22.1■■□□□ 1.13
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C9orf40Q8IXQ3 194 aa22.1■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPR151Q8TDV0 419 aa22.1■■□□□ 1.13
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF347Q96SE7 839 aa22.1■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF607Q96SK3 696 aa22.1■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 REEP1Q9H902 201 aa22.1■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 THSD1Q9NS62 852 aa22.1■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NDUFAF4Q9P032 175 aa22.1■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TERTO14746 1132 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DYRK3O43781 588 aa22.1■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TNFAIP8O95379 198 aa22.1■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ALOX5P09917 674 aa22.1■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MYBPC1Q00872 1141 aa22.1■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 DNASE1L3Q13609 305 aa22.1■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GNA13Q14344 377 aa22.1■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPAT3Q53EU6 434 aa22.1■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 KRT80Q6KB66 452 aa22.1■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa22.1■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR7G1Q8NGA0 311 aa22.1■■□□□ 1.13
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR1N1Q8NGS0 311 aa22.1■■□□□ 1.13
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