RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 SERTAD2Q14140 314 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP19Q14CB8 494 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 GPR149Q86SP6 731 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 AMY2AP04746 511 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 GALK2Q01415 458 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 BCL2L15Q5TBC7 163 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 CARD17Q5XLA6 110 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 FAM198BQ6UWH4 519 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 PDZD3Q86UT5 571 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 KIF18BQ86Y91 864 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 DOK4Q8TEW6 326 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 SCML1Q9UN30 329 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 PHLPP1O60346 1717 aa20■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R3DO95685 299 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 CHMP24386 653 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 CD34P28906 385 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 UQCRC1P31930 480 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 IGFN1Q86VF2 1251 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 ARL14Q8N4G2 192 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 FOXJ1Q92949 421 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 NEIL2Q969S2 332 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 CENPBD1B2RD01 187 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 CDK1P06493 297 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF35P13682 527 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 VIPR2P41587 438 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 HHEXQ03014 270 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 PLXDC1Q8IUK5 500 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 TCEAL3Q969E4 200 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 SLC6A16Q9GZN6 736 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 CNIH4Q9P003 139 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 SLC10A3P09131 477 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 PRSS3P35030 304 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 RAB41Q5JT25 222 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 HMBOX1Q6NT76 420 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 CNIH2Q6PI25 160 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 DPPA4Q7L190 304 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 GALNT6Q8NCL4 622 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 C3orf30Q96M34 536 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 DPH1Q9BZG8 443 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 THSD1Q9NS62 852 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 SLC7A7Q9UM01 511 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 PTH2RP49190 550 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 PM20D2Q8IYS1 436 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 B3GNT7Q8NFL0 401 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 PRRC1Q96M27 445 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 CLMPQ9H6B4 373 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 IL20RAQ9UHF4 553 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 CEPT1Q9Y6K0 416 aa19.99■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 MAN2B1O00754 1011 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 PNMTP11086 282 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 CPXM2Q8N436 756 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 CSNK1DP48730 415 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 S100A12P80511 92 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 TMPPEQ6ZT21 453 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 CBLL1Q75N03 491 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 OR2T35Q8NGX2 323 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV18A0A075B6X5 111 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 BMPR1AP36894 532 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 METTL11BQ5VVY1 283 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF619Q8N2I2 560 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 DEDD2Q8WXF8 326 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL15Q96M94 604 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 FZD3Q9NPG1 666 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 ZFP57Q9NU63 452 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 USP3Q9Y6I4 520 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 PRAF2O60831 178 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 CNMDO75829 334 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 SC5DO75845 299 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 THBS2P35442 1172 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 MC3RP41968 323 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 RELAQ04206 551 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 NSDHLQ15738 373 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 SLC35F2Q8IXU6 374 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 OR5W2Q8NH69 310 aa19.98■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0G2JMP0 313 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 RABIFP47224 123 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 MALLQ13021 153 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 RAET1LQ5VY80 246 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 OR4M2Q8NGB6 313 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM239Q8WW34 195 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 SUSD2Q9UGT4 822 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 PAHP00439 452 aa19.97■□□□□ 0.79
CCSAP-201ENST00000284617 ITGB7P26010 798 aa19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms