RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 LIPGQ9Y5X9 500 aa20.38■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 KCNE3Q9Y6H6 103 aa20.38■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 PRAMEF25A6NGN4 478 aa20.37■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 PDE9AO76083 593 aa20.37■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 KCNK2O95069 426 aa20.37■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 CD1EP15812 388 aa20.37■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 IL12BP29460 328 aa20.37■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 PRIM2P49643 509 aa20.37■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 TP53BP2Q13625 1128 aa20.37■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 DECR1Q16698 335 aa20.37■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 VPS26BQ4G0F5 336 aa20.37■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 CGB2Q6NT52 195 aa20.37■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 CDC73Q6P1J9 531 aa20.37■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 C6orf120Q7Z4R8 191 aa20.37■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 ZAR1Q86SH2 424 aa20.37■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 WDSUB1Q8N9V3 476 aa20.37■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 MOAP1Q96BY2 351 aa20.37■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 STACQ99469 402 aa20.37■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 INPP5KQ9BT40 448 aa20.37■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 ACTRT3Q9BYD9 372 aa20.37■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 PIGUQ9H490 435 aa20.37■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 CCDC134Q9H6E4 229 aa20.37■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 METTL7AQ9H8H3 244 aa20.37■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 SERHLQ9NQF3 203 aa20.37■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 DUSP22Q9NRW4 184 aa20.37■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 PCNX3Q9H6A9 2034 aa20.36■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 A0A1B0GTH9 108 aa20.36■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 C17orf51A8MQB3 221 aa20.36■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 ACOT7O00154 380 aa20.36■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 ALOX5P09917 674 aa20.36■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 KRT20P35900 424 aa20.36■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 CDKN2CP42773 168 aa20.36■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 TIGD3Q6B0B8 471 aa20.36■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 SPPL2CQ8IUH8 684 aa20.36■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 FUNDC1Q8IVP5 155 aa20.36■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 VPS37AQ8NEZ2 397 aa20.36■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 ZNF597Q96LX8 424 aa20.36■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 OR52E6Q96RD3 313 aa20.36■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 OSBPL11Q9BXB4 747 aa20.36■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 SLC52A3Q9NQ40 469 aa20.36■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 LRRK2Q5S007 2527 aa20.36■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 A0A1B0GVC2 190 aa20.35■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 GNB5O14775 395 aa20.35■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 SNPHO15079 494 aa20.35■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 IL6P05231 212 aa20.35■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 RNF224P0DH78 156 aa20.35■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 UQCRC2P22695 453 aa20.35■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 PTPN6P29350 595 aa20.35■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 RPS26P62854 115 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 SLC10A1Q14973 349 aa20.35■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 SPDYE7PQ495Y7 208 aa20.35■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 MYO7BQ6PIF6 2116 aa20.35■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 APOOLQ6UXV4 268 aa20.35■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 TRILQ7L0X0 811 aa20.35■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 GALNT10Q86SR1 603 aa20.35■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 PACS2Q86VP3 889 aa20.35■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 MIER2Q8N344 545 aa20.35■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 CDS1Q92903 461 aa20.35■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB18Q99592 522 aa20.35■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 NPHS2Q9NP85 383 aa20.35■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 SLC6A13Q9NSD5 602 aa20.35■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 KLRF1Q9NZS2 232 aa20.35■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 DCTN4Q9UJW0 460 aa20.35■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 PCDHGB4Q9UN71 923 aa20.35■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa20.34■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 SLC19A2O60779 497 aa20.34■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 KCNH1O95259 989 aa20.34■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 SOAT1P35610 550 aa20.34■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 CCNJQ5T5M9 372 aa20.34■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 SAXO2Q658L1 398 aa20.34■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 FIGNL1Q6PIW4 674 aa20.34■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa20.34■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 FAM26EQ8N5C1 309 aa20.34■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 OR5D16Q8NGK9 328 aa20.34■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 OR4C3Q8NH37 302 aa20.34■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 MIPOL1Q8TD10 442 aa20.34■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 RELTQ969Z4 430 aa20.34■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 OR7D2Q96RA2 312 aa20.34■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 BTBD2Q9BX70 525 aa20.34■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 ZNF385DQ9H6B1 395 aa20.34■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 ACKR4Q9NPB9 350 aa20.34■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa20.34■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 QPCTLQ9NXS2 382 aa20.34■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 C15orf41Q9Y2V0 281 aa20.34■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 UTS2O95399 124 aa20.33■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 MATN1P21941 496 aa20.33■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 EVI2BP34910 448 aa20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.1 ms