RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 SYT7O43581 403 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 NOVP48745 357 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 ZNF81P51508 661 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 FXYD6P3P58550 94 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 SLC7A9P82251 487 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 NTRK2Q16620 822 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 ACTBL2Q562R1 376 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 C22orf42Q6IC83 251 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 TMEM150AQ86TG1 271 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 KIF18BQ86Y91 864 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 APCDD1Q8J025 514 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 BADQ92934 168 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 ANKRD60Q9BZ19 345 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 RLIMQ9NVW2 624 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 SLC39A1Q9NY26 324 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 CD8B2A6NJW9 211 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 IFNA17P01571 189 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 RPS17P08708 135 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 CD8BP10966 210 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 CBLP22681 906 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 SOX2P48431 317 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 PPP5CP53041 499 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 WNT4P56705 351 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 SLC26A5P58743 744 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 CLVS2Q5SYC1 327 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 METTL11BQ5VVY1 283 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 FAM198BQ6UWH4 519 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 COMMD6Q7Z4G1 85 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 SYT14Q8NB59 555 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 SGIP1Q9BQI5 828 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 TMEM185BQ9H7F4 350 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 CPNE5Q9HCH3 593 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 TAS2R3Q9NYW6 316 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 LDB2O43679 373 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 ADAM23O75077 832 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 SC5DO75845 299 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 IDUAP35475 653 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 PTPRCAPQ14761 206 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 NADSYN1Q6IA69 706 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 KDELC1Q6UW63 502 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 DEFB119Q8N690 84 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 GATSQ8NAP1 163 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 WDR20Q8TBZ3 569 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 UBTD2Q8WUN7 234 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 DIO2Q92813 273 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 SCAMP4Q969E2 229 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 AMDHD1Q96NU7 426 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 GORASP2Q9H8Y8 452 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 PDLIM7Q9NR12 457 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 ZNF337Q9Y3M9 751 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 LOC100509620A0A075B734 347 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 RNF212BA8MTL3 300 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 GABBR2O75899 941 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 MAOAP21397 527 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 CST5P28325 142 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 CD70P32970 193 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 SLC35G1Q2M3R5 365 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 ABHD17BQ5VST6 288 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 ENPP6Q6UWR7 440 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 STEAP2Q8NFT2 490 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 OR8K5Q8NH50 307 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 CD200R1Q8TD46 325 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 CREB3L4Q8TEY5 395 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 TBC1D20Q96BZ9 403 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 HSPB11Q9Y547 144 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 MYH2Q9UKX2 1941 aa6.83□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 ZNF860A6NHJ4 632 aa6.82□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 CNMDO75829 334 aa6.82□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 IFNA4P05014 189 aa6.82□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 AKAIN1P0CW23 69 aa6.82□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 DNASE1P24855 282 aa6.82□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 PKLRP30613 574 aa6.82□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 GCH1P30793 250 aa6.82□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 GPR4P46093 362 aa6.82□□□□□ -1.32
CPS1-201ENST00000233072 BDH1Q02338 343 aa6.82□□□□□ -1.32
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