RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 ANKK1Q8NFD2 765 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 TSPAN17Q96FV3 270 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 EFCAB11Q9BUY7 163 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 DPH5Q9H2P9 285 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 FANCFQ9NPI8 374 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 EHD3Q9NZN3 535 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 RAB21Q9UL25 225 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM89A2RUT3 159 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 DPRXA6NFQ7 191 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 FAM187AA6NFU0 413 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 CLGNO14967 610 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 SEC14L5O43304 696 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 RAD51CO43502 376 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 RAMP1O60894 148 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 SH3BGRLO75368 114 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 SLC35E2BP0CK96 405 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 SLC35E2P0CK97 266 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 STMN1P16949 149 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 ADH6P28332 368 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 NEK2P51955 445 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 C21orf58P58505 322 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 RAB10P61026 200 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 ACTG1P63261 375 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 DLG1Q12959 904 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 TBCCQ15814 346 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM35AQ53FP2 167 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 CYS1Q717R9 158 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 GALNT12Q8IXK2 581 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 METTL25Q8N6Q8 603 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 STEAP2Q8NFT2 490 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 CDKL2Q92772 493 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 DTNBP1Q96EV8 351 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 ERP44Q9BS26 406 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 NGBQ9NPG2 151 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 CD274Q9NZQ7 290 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 PHF11Q9UIL8 331 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 GLOD5A6NK44 160 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 VWC2LB2RUY7 222 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 SAP18O00422 153 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 CSF3P09919 207 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 CASP2P42575 452 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 SLC6A8P48029 635 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 CDH11P55287 796 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 CLDN20P56880 219 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 PLCXD2Q0VAA5 305 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 CHIT1Q13231 466 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 AGAP6Q5VW22 663 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 OR5M10Q6IEU7 315 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 CMC1Q7Z7K0 106 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 IFT20Q8IY31 132 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 BANPQ8N9N5 519 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 UBTD2Q8WUN7 234 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 EXT2Q93063 718 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 ATOH8Q96SQ7 321 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC1Q9BTT6 524 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 CD244Q9BZW8 370 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 ALG9Q9H6U8 611 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF696Q9H7X3 374 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 TXNDC16Q9P2K2 825 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 CLEC4AQ9UMR7 237 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 SNX8Q9Y5X2 465 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 C17orf51A8MQB3 221 aa14.6□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 ATP8B1O43520 1251 aa14.6□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 IRF8Q02556 426 aa14.6□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 CALCOCO2Q13137 446 aa14.6□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 LAPTM5Q13571 262 aa14.6□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 GGTLC2Q14390 218 aa14.6□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 PAGE2BQ5JRK9 111 aa14.6□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 OR4C11Q6IEV9 310 aa14.6□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 FIGNL1Q6PIW4 674 aa14.6□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 ISCA2Q86U28 154 aa14.6□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 LAS2Q8IYD9 372 aa14.6□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF619Q8N2I2 560 aa14.6□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 ITPAQ9BY32 194 aa14.6□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 NUDT4Q9NZJ9 180 aa14.6□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF337Q9Y3M9 751 aa14.6□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 A0A0A6YYJ9 748 aa14.59□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 SLCO1B7G3V0H7 640 aa14.59□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 H7C417 338 aa14.59□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 ACOX3O15254 700 aa14.59□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 TGFAP01135 160 aa14.59□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 GSTA2P09210 222 aa14.59□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 NR2F6P10588 404 aa14.59□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 MTHFD2P13995 350 aa14.59□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 S1PR1P21453 382 aa14.59□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 GRK2P25098 689 aa14.59□□□□□ -0.07
SPCS1-201ENST00000233025 CTBP2P56545 445 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms