RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tssk6Q925K9 273 aa15.18■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Insm2Q9JMC2 493 aa15.18■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ChmlQ9QZD5 621 aa15.18■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tbl2Q9R099 442 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp472B0V2W5 534 aa15.18■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gcm2O09102 504 aa15.18■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdk1P11440 297 aa15.18■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 F9P16294 471 aa15.18■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SgcgP82348 291 aa15.18■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Runx3Q64131 409 aa15.18■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 E330021D16RikQ8BW45 371 aa15.18■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ssuh2Q8C3L1 340 aa15.18■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Unc5dQ8K1S2 956 aa15.18■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DynapQ9D7M5 161 aa15.18■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pmepa1Q9D7R2 260 aa15.18■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mcm3apQ9WUU9 1971 aa15.18■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm13283A0A087WPG5 182 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Malrd1A2AJX4 2123 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm8973D3YX71 104 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AU018091E9PWS4 684 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dcpp3L7N259 170 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 FxnO35943 207 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fzd1O70421 642 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mup3P04939 184 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Phxr1P15973 60 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DctP29812 517 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tbx6P70327 436 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 EvlP70429 414 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmprss11cQ1JRP2 431 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf786Q8BV42 777 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Foxe1Q8R2I0 371 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ffar2Q8VCK6 330 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc3a1Q91WV7 685 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ntn4Q9JI33 628 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adam34A2RSG8 714 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Glb1l3A2RSQ1 649 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r13G5E8I3 300 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hax1O35387 280 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tcf3P15806 651 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adra1aP97718 466 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nlrc3Q5DU56 1064 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdkn2dQ60773 166 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr765Q7TRI6 309 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Acat3Q80X81 397 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdkl3Q8BLF2 595 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sdr9c7Q8K3P0 313 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r87Q8R255 295 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr767Q8VG33 309 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tram2Q924Z5 370 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mrps33Q9D2R8 106 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Natd1Q9DBW3 110 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppm1dQ9QZ67 598 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PrknQ9WVS6 464 aa15.17■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gsg1lD3Z7H4 322 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm8906L7N2A2 181 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rdh5O55240 318 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zp2P20239 713 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Guca1aP43081 202 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr591Q7TRR7 314 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc35f1Q8BGK5 408 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp763Q8BIC7 588 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kctd7Q8BJK1 289 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfm2Q8BM13 448 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zcchc3Q8BPK2 400 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Serpina11Q8CIE0 424 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc31a1Q8K211 196 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc9a8Q8R4D1 576 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1020Q8VFK7 317 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr821Q8VG45 310 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr669Q8VGU9 317 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Acot7Q91V12 381 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CenpnQ9CZW2 337 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Chrm3Q9ERZ3 589 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Plscr3Q9JIZ9 296 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arid1aA2BH40 2283 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcdhgb8A0A140LI48 931 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mgl2A9XX86 381 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm7970L7N271 213 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm7980L7N471 213 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 OsmrO70458 971 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 FshrP35378 692 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cct3P80318 545 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem64Q3U145 381 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Eml4Q3UMY5 988 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lcn3Q62471 182 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GnptgQ6S5C2 307 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tas2r110Q7M712 333 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam69cQ8BQT2 410 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Erlec1Q8VEH8 483 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SdhcQ9CZB0 169 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1366A0A1W2P740 328 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm13078A2AGW8 474 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CatP24270 527 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Htr7P32304 448 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zic1P46684 447 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rln1P47932 185 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hif3aQ0VBL6 662 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Crhr2Q60748 411 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr855Q7TRF8 312 aa15.16■□□□□ 0.02
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccm2Q8K2Y9 453 aa15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.2 ms