RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636621.1

LINC00598-211, long intergenic non-protein coding RNA 598, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LINC00598, Length 3,241 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00598-211ENST00000636621 IL17FQ96PD4 163 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 PRR14Q9BWN1 585 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 SLC38A1Q9H2H9 487 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 ING3Q9NXR8 418 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 PTTG3PQ9NZH4 202 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 C5AR2Q9P296 337 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 OR6C70A6NIJ9 312 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 PRR19A6NJB7 356 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 CASKO14936 926 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 ADH1AP07327 375 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 ACP5P13686 325 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 THBS2P35442 1172 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 GPR1P46091 355 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 CDH11P55287 796 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 ARPC4P59998 168 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 CSNK1G2P78368 415 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 ST3GAL3Q11203 375 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 ADAM15Q13444 863 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 AGERQ15109 404 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 C9orf64Q5T6V5 341 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 RAET1GQ6H3X3 334 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 NR2C2APQ86WQ0 139 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 OR5M3Q8NGP4 307 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 OR4Q3Q8NH05 313 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 CD99L2Q8TCZ2 262 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 ARRDC3Q96B67 414 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 TCEAL4Q96EI5 215 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 HYLS1Q96M11 299 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 DPH7Q9BTV6 452 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 FN3KQ9H479 309 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 CALML5Q9NZT1 146 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 LAMA3Q16787 3333 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 ANKRD61A6NGH8 418 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 LRRTM2O43300 516 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 CSF2P04141 144 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 PSKH1P11801 424 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 ADRB3P13945 408 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 TEAD1P28347 426 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 WEE1P30291 646 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 BTCP35070 178 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 SOX18P35713 384 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 TRIM23P36406 574 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 IL12RB1P42701 662 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 TLE2Q04725 743 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 MAB21L1Q13394 359 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 FAM209AQ5JX71 171 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 SMARCD3Q6STE5 483 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 PAMR1Q6UXH9 720 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 ADCK2Q7Z695 626 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 DEFB128Q7Z7B8 93 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 CDH24Q86UP0 819 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 AMZ2Q86W34 360 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 TEX19Q8NA77 164 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 LINC01555Q8NAE3 123 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 XAGE5Q8WWM1 108 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 GIMAP5Q96F15 307 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 FAIM2Q9BWQ8 316 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 MFRPQ9BY79 579 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 KCNN2Q9H2S1 579 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 PIGUQ9H490 435 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 INPP5EQ9NRR6 644 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 TBX21Q9UL17 535 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 FAM170BA6NMN3 283 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 PLOD3O60568 738 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 FGF18O76093 207 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 OR5F1O95221 314 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 THY1P04216 161 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 M6PRP20645 277 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 NTSP30990 170 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 CAPZA2P47755 286 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 METAP1P53582 386 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 NUMA1Q14980 2115 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 ANGPT1Q15389 498 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 TEAD2Q15562 447 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 TRAM1Q15629 374 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 PGGHGQ32M88 737 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 PLPP4Q5VZY2 271 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 BICRALQ6AI39 1079 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 PXKQ7Z7A4 578 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 OAFQ86UD1 273 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 GID4Q8IVV7 300 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00598-211ENST00000636621 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms