RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599909.1

RPS5-208, Transcript of ribosomal protein S5, human

TSL 2

Gene RPS5, Length 523 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS5-208	ENST00000599909	CLDN15	P56746	228 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	SIRPA	P78324	504 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	SLC7A5	Q01650	507 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	10.12	□□□□□ -0.79	3e-13	■■■■□ 20.1
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF550	Q7Z398	422 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	NUDT8	Q8WV74	236 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	FIG4	Q92562	907 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	PGM2	Q96G03	612 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	VSTM2L	Q96N03	204 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	TMCO1	Q9UM00	188 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	SLC22A20	A6NK97	555 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909		A8MT66	165 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	SCO2	O43819	266 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	ESRRB	O95718	433 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	OTC	P00480	354 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	CRH	P06850	196 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	IL3	P08700	152 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	PCSK6	P29122	969 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	UGT2B10	P36537	528 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	PNLIPRP2	P54317	469 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	EFR3A	Q14156	821 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	BCL2A1	Q16548	175 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	ACKR1	Q16570	336 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	FADS6	Q8N9I5	356 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	OR7G2	Q8NG99	324 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	PIGT	Q969N2	578 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	PERP	Q96FX8	193 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	MARK4	Q96L34	752 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	CCL19	Q99731	98 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	MDFI	Q99750	246 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	MED18	Q9BUE0	208 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	DSN1	Q9H410	356 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	MCM8	Q9UJA3	840 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	SNX6	Q9UNH7	406 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	MANBA	O00462	879 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	SEC14L5	O43304	696 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	CGA	P01215	116 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	PEPD	P12955	493 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	POU2F1	P14859	743 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	HK1	P19367	917 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	FPR1	P21462	350 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	EVI2B	P34910	448 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	PHB	P35232	272 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	KRT20	P35900	424 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	PCYT1A	P49585	367 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	RAET1L	Q5VY80	246 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	OR2A2	Q6IF42	318 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	OR2M3	Q8NG83	312 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	ERP27	Q96DN0	273 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	PAFAH2	Q99487	392 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	PINK1	Q9BXM7	581 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	MED11	Q9P086	117 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPS5-208	ENST00000599909	INAFM1	C9JVW0	142 aa		10.09	□□□□□ -0.79

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