RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 SNX6Q9UNH7 406 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 ZANQ9Y493 2812 aa9.31□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 JMJD1CQ15652 2540 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 C17orf51A8MQB3 221 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 PPP6CO00743 305 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 SMIM24O75264 130 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 NME6O75414 186 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 PEPDP12955 493 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 POU2F1P14859 743 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 KRT20P35900 424 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 UGT2B10P36537 528 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 PNLIPRP2P54317 469 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 PSPHP78330 225 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM219BQ5XKK7 198 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 CHMP1BQ7LBR1 199 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC116Q8IYX3 515 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 FADS6Q8N9I5 356 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 OR4K17Q8NGC6 315 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 OR9A2Q8NGT5 310 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 KAT2AQ92830 837 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 PERPQ96FX8 193 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 MARK4Q96L34 752 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 HBEGFQ99075 208 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 ACSS3Q9H6R3 686 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 FOLH1BQ9HBA9 442 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 PFDN4Q9NQP4 134 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 NMRK1Q9NWW6 199 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 ELOVL5Q9NYP7 299 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 MCM8Q9UJA3 840 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF225Q9UK10 706 aa9.3□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 PCNX3Q9H6A9 2034 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 TRIM64A6NGJ6 449 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 TRIM64BA6NI03 449 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 C16orf97H3BN30 126 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 EMC8O43402 210 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 ESRRBO95718 433 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 CGAP01215 116 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 CTAGE8P0CG41 777 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 HSD3B1P14060 373 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 TSPAN8P19075 237 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 HSD3B2P26439 372 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 LOXP28300 417 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 PCSK6P29122 969 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 EVI2BP34910 448 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 PHBP35232 272 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 CDH13P55290 713 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 CLDN15P56746 228 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 SIRPAP78324 504 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 C20orf204Q6ZNR8 217 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF550Q7Z398 422 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 CTAGE4Q8IX94 777 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 UBQLNLQ8IYU4 475 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 MEIOBQ8N635 442 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 OR4N2Q8NGD1 307 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 FIG4Q92562 907 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 HS3ST6Q96QI5 342 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 MDFIQ99750 246 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC39A3Q9BRY0 314 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 PINK1Q9BXM7 581 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 RNF122Q9H9V4 155 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 GRPEL1Q9HAV7 217 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 VPS29Q9UBQ0 182 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 TRPS1Q9UHF7 1281 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 PYCARDQ9ULZ3 195 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 TLN2Q9Y4G6 2542 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 HIVEP2P31629 2446 aa9.29□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 ESYT3A0FGR9 886 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 A8MT66 165 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 H0YC42 278 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 SCO2O43819 266 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 PCDH7O60245 1069 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 PLOD3O60568 738 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 TNFRSF21O75509 655 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 OR4F21O95013 312 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 IL3P08700 152 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 SBK3P0C264 359 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 CD8BP10966 210 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 COL6A2P12110 1019 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNJ5P48544 419 aa9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
EFTUD2-226ENST00000593200 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms