RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592790.1

VMP1-216, Transcript of vacuole membrane protein 1, human

Gene VMP1, Length 4,325 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VMP1-216	ENST00000592790	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	C12orf73	Q69YU5	71 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	TMEM64	Q6YI46	380 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	HTR3D	Q70Z44	454 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	UTS2B	Q765I0	119 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	DPPA4	Q7L190	304 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	NRROS	Q86YC3	692 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	LAS2	Q8IYD9	372 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	LILRB2	Q8N423	598 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF614	Q8N883	585 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	FCRL1	Q96LA6	429 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	C12orf66	Q96MD2	445 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	COQ10A	Q96MF6	247 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	OR2AG1	Q9H205	316 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	ICK	Q9UPZ9	632 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	NUP205	Q92621	2012 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMP1-216	ENST00000592790	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	ACOT7	O00154	380 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	GABRP	O00591	440 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	HPGDS	O60760	199 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	ADAMTS4	O75173	837 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF254	O75437	659 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	SLC16A8	O95907	504 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	LALBA	P00709	142 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	EPHX1	P07099	455 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	UCHL1	P09936	223 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	GKN3P	P0CG01	181 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	SRC	P12931	536 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	EDNRA	P25101	427 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	HTR1F	P30939	366 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	HOXA9	P31269	272 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	SLC1A3	P43003	542 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	AVPR1B	P47901	424 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	MAN2A2	P49641	1150 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	FLT3LG	P49771	235 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	PRMT2	P55345	433 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	P2RX3	P56373	397 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	PFN3	P60673	137 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	RAB33A	Q14088	237 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	IRF4	Q15306	451 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	GRK1	Q15835	563 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	PGGHG	Q32M88	737 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	PYCR3	Q53H96	274 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	SAXO2	Q658L1	398 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF550	Q7Z398	422 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	GALNT10	Q86SR1	603 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	KLB	Q86Z14	1044 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	COX18	Q8N8Q8	333 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	ELP4	Q96EB1	424 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	ZNF559	Q9BR84	538 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	ALG8	Q9BVK2	526 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	BEX2	Q9BXY8	128 aa		3.34	□□□□□ -1.88
VMP1-216	ENST00000592790	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		3.34	□□□□□ -1.88

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