RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 CD53P19397 219 aa10.97□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 HOXC12P31275 282 aa10.97□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 CPA2P48052 419 aa10.97□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 CLDN18P56856 261 aa10.97□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 DCAF7P61962 342 aa10.97□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 ZNF844Q08AG5 666 aa10.97□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 RASA2Q15283 850 aa10.97□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 ENPP6Q6UWR7 440 aa10.97□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 TIFABQ6ZNK6 161 aa10.97□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 PLCZ1Q86YW0 608 aa10.97□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 CCDC116Q8IYX3 515 aa10.97□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 OR4N2Q8NGD1 307 aa10.97□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 RNF138Q8WVD3 245 aa10.97□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 WNT2BQ93097 391 aa10.97□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 SLC35A4Q96G79 324 aa10.97□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 VSTM2LQ96N03 204 aa10.97□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 TMEM237Q96Q45 408 aa10.97□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 UCN2Q96RP3 112 aa10.97□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 ADOQ96SZ5 270 aa10.97□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 TM9SF2Q99805 663 aa10.97□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 FAIM2Q9BWQ8 316 aa10.97□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 ACPTQ9BZG2 426 aa10.97□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 VIPAS39Q9H9C1 493 aa10.97□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 PFDN4Q9NQP4 134 aa10.97□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 ZNF446Q9NWS9 450 aa10.97□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 VPS29Q9UBQ0 182 aa10.97□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 PRODH2Q9UF12 536 aa10.97□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa10.97□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa10.97□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 A0A1W2PNV4 684 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 SIAH2O43255 324 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 HCRTR2O43614 444 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 PCDH7O60245 1069 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 ZIC3O60481 467 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 ESRRBO95718 433 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 GRK2P25098 689 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 SRD5A2P31213 254 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 GCKP35557 465 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 CPOXP36551 454 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 GAS1P54826 345 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 B3GALT5-AS1P59052 145 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 CLCQ05315 142 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 PRSS53Q2L4Q9 553 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 UNC50Q53HI1 259 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 Q71RC1 249 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 TAOK1Q7L7X3 1001 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 OR7G2Q8NG99 324 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 TMCO6Q96DC7 493 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 APIPQ96GX9 242 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 SFXN2Q96NB2 322 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 ZFP3Q96NJ6 502 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 DACH2Q96NX9 599 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 EBPLQ9BY08 206 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 FOLH1BQ9HBA9 442 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 FLRT3Q9NZU0 649 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 MCM8Q9UJA3 840 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 DKKL1Q9UK85 242 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 PSME2Q9UL46 239 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 EDARQ9UNE0 448 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 TESMINQ9Y4I5 508 aa10.96□□□□□ -0.65
CTIF-208ENST00000590422 ROS1P08922 2347 aa10.96□□□□□ -0.66
CTIF-208ENST00000590422 TLN2Q9Y4G6 2542 aa10.95□□□□□ -0.66
CTIF-208ENST00000590422 TLDC2A0PJX2 215 aa10.95□□□□□ -0.66
CTIF-208ENST00000590422 SMIM23A6NLE4 172 aa10.95□□□□□ -0.66
CTIF-208ENST00000590422 A8MXE2 369 aa10.95□□□□□ -0.66
CTIF-208ENST00000590422 SASH3O75995 380 aa10.95□□□□□ -0.66
CTIF-208ENST00000590422 DRD2P14416 443 aa10.95□□□□□ -0.66
CTIF-208ENST00000590422 FOSL1P15407 271 aa10.95□□□□□ -0.66
CTIF-208ENST00000590422 CCKARP32238 428 aa10.95□□□□□ -0.66
CTIF-208ENST00000590422 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
CTIF-208ENST00000590422 KRT71Q3SY84 523 aa10.95□□□□□ -0.66
CTIF-208ENST00000590422 ZNF678Q5SXM1 525 aa10.95□□□□□ -0.66
CTIF-208ENST00000590422 CEP85LQ5SZL2 805 aa10.95□□□□□ -0.66
CTIF-208ENST00000590422 VWA1Q6PCB0 445 aa10.95□□□□□ -0.66
CTIF-208ENST00000590422 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa10.95□□□□□ -0.66
CTIF-208ENST00000590422 CNPY4Q8N129 248 aa10.95□□□□□ -0.66
CTIF-208ENST00000590422 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
CTIF-208ENST00000590422 MZB1Q8WU39 189 aa10.95□□□□□ -0.66
CTIF-208ENST00000590422 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
CTIF-208ENST00000590422 KCNA7Q96RP8 456 aa10.95□□□□□ -0.66
CTIF-208ENST00000590422 ZNF382Q96SR6 550 aa10.95□□□□□ -0.66
CTIF-208ENST00000590422 RTN4RQ9BZR6 473 aa10.95□□□□□ -0.66
CTIF-208ENST00000590422 TMEM216Q9P0N5 145 aa10.95□□□□□ -0.66
CTIF-208ENST00000590422 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
CTIF-208ENST00000590422 LGALS13Q9UHV8 139 aa10.95□□□□□ -0.66
CTIF-208ENST00000590422 PACSIN3Q9UKS6 424 aa10.95□□□□□ -0.66
CTIF-208ENST00000590422 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
CTIF-208ENST00000590422 PRR14LQ5THK1 2151 aa10.94□□□□□ -0.66
CTIF-208ENST00000590422 HEATR5AQ86XA9 2040 aa10.94□□□□□ -0.66
CTIF-208ENST00000590422 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa10.94□□□□□ -0.66
CTIF-208ENST00000590422 H0YC42 278 aa10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms