RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 OR2AG1Q9H205 316 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 EBF3Q9H4W6 596 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM231Q9H6L2 316 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 BCO1Q9HAY6 547 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SGK2Q9HBY8 427 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 BIN3Q9NQY0 253 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM161AQ9NX61 479 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 IMPAD1Q9NX62 359 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SLC2A8Q9NY64 477 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 HEY2Q9UBP5 337 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF639Q9UID6 485 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MSRAQ9UJ68 235 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CDH22Q9UJ99 828 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ANAPC7Q9UJX3 599 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 IKZF3Q9UKT9 509 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 COPS3Q9UNS2 423 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CA5BQ9Y2D0 317 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 KLK4Q9Y5K2 254 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MAP3K1Q13233 1512 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CARMIL3Q8ND23 1372 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 NCOA1Q15788 1441 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC88BA6NC98 1476 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1W2PNV4 684 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 LNP1A1A4G5 178 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TRABD2BA6NFA1 517 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 WIPF3A6NGB9 483 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 GAGE10A6NGK3 116 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SDR42E2A6NKP2 422 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CCT8L1PA6NM43 557 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ANKRD66B4E2M5 251 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MCIDASD6RGH6 385 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 H3BN98 237 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CDC7O00311 574 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 EMC8O43402 210 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 NRP2O60462 931 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 UGT1A9O60656 530 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ADAP1O75689 374 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 DCTN3O75935 186 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SOX30O94993 753 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ZWINTO95229 277 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CELF2O95319 508 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ADAP00813 363 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 IFNA21P01568 189 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PPBPP02775 128 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 FTH1P02794 183 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ICAM1P05362 532 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 LPLP06858 475 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PROS1P07225 676 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PAEPP09466 180 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 OR52Z1P0C646 297 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 NBEAP1P0C6P0 100 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 EBLN1P0CF75 366 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 RD3LP0DJH9 198 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CYP11B1P15538 503 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF44P15621 663 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CD1EP15812 388 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 DPEP1P16444 411 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PAICSP22234 425 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ACKR3P25106 362 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ELK4P28324 431 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PRDX6P30041 224 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CA5AP35218 305 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ARR3P36575 388 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 CEACAM3P40198 252 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 RPL35P42766 123 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 BRCC3P46736 316 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PNLIPRP2P54317 469 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ADPRHP54922 357 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MANFP55145 182 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MLLT10P55197 1068 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ATP5J2P56134 94 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 WNT3P56703 355 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SLC37A1P57057 533 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 PROK1P58294 105 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 UFM1P61960 85 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ERVK-25P63136 954 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 VLDLRP98155 873 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 MYBPC1Q00872 1141 aa2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58 ms