RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567015.5

UTP4-208, Transcript of UTP4, small subunit processome component, human

TSL 2

Gene UTP4, Length 690 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UTP4-208	ENST00000567015	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	AHRR	A9YTQ3	701 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	FADS1	O60427	444 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	REM1	O75628	298 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	LRAT	O95237	230 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	CLDN14	O95500	239 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	HSPA4L	O95757	839 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	IL33	O95760	270 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	GABRA1	P14867	456 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	PRPS1L1	P21108	318 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	ACVR2A	P27037	513 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	PTGER4	P35408	488 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	SLC1A6	P48664	564 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	CLDN8	P56748	225 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	CDSN	Q15517	529 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	ACAD11	Q709F0	780 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	LIX1	Q8N485	282 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	FAM110B	Q8TC76	370 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	AGR3	Q8TD06	166 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	ADO	Q96SZ5	270 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	CHST11	Q9NPF2	352 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	CBLC	Q9ULV8	474 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	MAST4	O15021	2626 aa		10.79	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	TMEM120B	A0PK00	339 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015		B4DXG7	233 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	ANKRD28	O15084	1053 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	EMC8	O43402	210 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	AKAP10	O43572	662 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	SOX30	O94993	753 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	LAMP1	P11279	417 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	BGN	P21810	368 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	GDF1	P27539	372 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	HTR1E	P28566	365 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	BST1	Q10588	318 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	STX3	Q13277	289 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	PTGR1	Q14914	329 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	WLS	Q5T9L3	541 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	OGFOD2	Q6N063	350 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	RPRML	Q8N4K4	120 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	ASB5	Q8WWX0	329 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	RND1	Q92730	232 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	TIMP4	Q99727	224 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	CENPH	Q9H3R5	247 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	LDAH	Q9H6V9	325 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015		Q9N2J8	555 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	ITPR2	Q14571	2701 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		10.78	□□□□□ -0.68
UTP4-208	ENST00000567015	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UTP4-208	ENST00000567015	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UTP4-208	ENST00000567015		A0A1W2PRB8	838 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UTP4-208	ENST00000567015	PRSS44	E7EML9	344 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UTP4-208	ENST00000567015	KLF11	O14901	512 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UTP4-208	ENST00000567015	SCN2B	O60939	215 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UTP4-208	ENST00000567015	EPPIN	O95925	133 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UTP4-208	ENST00000567015	ACTL6A	O96019	429 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UTP4-208	ENST00000567015	NGFR	P08138	427 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UTP4-208	ENST00000567015	GLI4	P10075	376 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UTP4-208	ENST00000567015	G6PD	P11413	515 aa		10.77	□□□□□ -0.69
UTP4-208	ENST00000567015	CYP4B1	P13584	511 aa		10.77	□□□□□ -0.69

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