RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560631.1

RNF31-222, Transcript of ring finger protein 31, human

TSL 2

Gene RNF31, Length 320 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF31-222	ENST00000560631	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	LUZP4	Q9P127	313 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	SLC22A3	O75751	556 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	SNX4	O95219	450 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	CBX6	O95503	412 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	IL33	O95760	270 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	PGR	P06401	933 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	KRT16	P08779	473 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	EDN3	P14138	238 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	PIGA	P37287	484 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	CASP3	P42574	277 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	MAGEA8	P43361	318 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	PRIM2	P49643	509 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	MEOX1	P50221	254 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	AQP5	P55064	265 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	FBXW4	P57775	412 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	GAB1	Q13480	694 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	EFR3A	Q14156	821 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	PGS1	Q32NB8	556 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	CDC73	Q6P1J9	531 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	GK5	Q6ZS86	529 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	SIAH3	Q8IW03	269 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	MIER2	Q8N344	545 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	DIO2	Q92813	273 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	CCDC115	Q96NT0	180 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	COL21A1	Q96P44	957 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	STAC	Q99469	402 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	ZBTB18	Q99592	522 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	EBF4	Q9BQW3	602 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	PIGU	Q9H490	435 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631		Q9N2J8	555 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	OLAH	Q9NV23	265 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	CBLC	Q9ULV8	474 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	FAM234B	A2RU67	622 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	PINLYP	A6NC86	204 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	DUXA	A6NLW8	204 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	CFLAR	O15519	480 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	UGT2B11	O75310	529 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	REM1	O75628	298 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	WISP1	O95388	367 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	ACP2	P11117	423 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	UQCRC2	P22695	453 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	MST1	P26927	711 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	GABRA3	P34903	492 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	PTGDS	P41222	190 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	TRPC1	P48995	793 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	MAN2A2	P49641	1150 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	PRKAG1	P54619	331 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	CORO7	P57737	925 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	GUCY1A3	Q02108	690 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	IGFBP7	Q16270	282 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	DECR1	Q16698	335 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	SAXO2	Q658L1	398 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	PRR22	Q8IZ63	422 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	FAM13C	Q8NE31	585 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	TMBIM1	Q969X1	311 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RNF31-222	ENST00000560631	TMCO6	Q96DC7	493 aa		7.37	□□□□□ -1.23

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